Protein–RNA interactions for Protein: Q13615

MTMR3, Myotubularin-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR3Q13615 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MTMR3Q13615 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
MTMR3Q13615 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MTMR3Q13615 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MTMR3Q13615 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MTMR3Q13615 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MTMR3Q13615 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MTMR3Q13615 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MTMR3Q13615 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MTMR3Q13615 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MTMR3Q13615 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MTMR3Q13615 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
MTMR3Q13615 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MTMR3Q13615 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MTMR3Q13615 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MTMR3Q13615 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
MTMR3Q13615 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MTMR3Q13615 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MTMR3Q13615 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MTMR3Q13615 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MTMR3Q13615 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MTMR3Q13615 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MTMR3Q13615 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MTMR3Q13615 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MTMR3Q13615 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MTMR3Q13615 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MTMR3Q13615 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MTMR3Q13615 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MTMR3Q13615 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MTMR3Q13615 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MTMR3Q13615 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MTMR3Q13615 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MTMR3Q13615 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MTMR3Q13615 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MTMR3Q13615 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
MTMR3Q13615 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
MTMR3Q13615 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MTMR3Q13615 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MTMR3Q13615 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MTMR3Q13615 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MTMR3Q13615 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
MTMR3Q13615 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MTMR3Q13615 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MTMR3Q13615 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MTMR3Q13615 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
MTMR3Q13615 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MTMR3Q13615 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MTMR3Q13615 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MTMR3Q13615 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MTMR3Q13615 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MTMR3Q13615 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MTMR3Q13615 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MTMR3Q13615 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MTMR3Q13615 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MTMR3Q13615 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MTMR3Q13615 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MTMR3Q13615 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MTMR3Q13615 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MTMR3Q13615 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MTMR3Q13615 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MTMR3Q13615 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MTMR3Q13615 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MTMR3Q13615 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MTMR3Q13615 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MTMR3Q13615 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MTMR3Q13615 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MTMR3Q13615 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MTMR3Q13615 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MTMR3Q13615 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MTMR3Q13615 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MTMR3Q13615 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MTMR3Q13615 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MTMR3Q13615 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MTMR3Q13615 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
MTMR3Q13615 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
MTMR3Q13615 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
MTMR3Q13615 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MTMR3Q13615 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
MTMR3Q13615 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MTMR3Q13615 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MTMR3Q13615 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MTMR3Q13615 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MTMR3Q13615 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MTMR3Q13615 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
MTMR3Q13615 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MTMR3Q13615 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MTMR3Q13615 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MTMR3Q13615 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
MTMR3Q13615 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
MTMR3Q13615 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MTMR3Q13615 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MTMR3Q13615 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MTMR3Q13615 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MTMR3Q13615 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MTMR3Q13615 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MTMR3Q13615 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MTMR3Q13615 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MTMR3Q13615 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MTMR3Q13615 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MTMR3Q13615 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67 ms