Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

Predictions only

Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 MIR4750-201ENST00000584564 56 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
ATRQ13535 COX6A1P2-201ENST00000620597 330 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
ATRQ13535 SRSF3-208ENST00000620941 869 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
ATRQ13535 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
ATRQ13535 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ATRQ13535 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ATRQ13535 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ATRQ13535 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ATRQ13535 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC12.69□□□□□ -0.38
ATRQ13535 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ATRQ13535 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
ATRQ13535 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
ATRQ13535 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC12.68□□□□□ -0.38
ATRQ13535 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
ATRQ13535 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
ATRQ13535 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
ATRQ13535 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
ATRQ13535 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
ATRQ13535 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
ATRQ13535 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
ATRQ13535 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
ATRQ13535 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
ATRQ13535 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
ATRQ13535 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
ATRQ13535 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
ATRQ13535 AC093151.3-202ENST00000445073 709 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
ATRQ13535 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
ATRQ13535 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
ATRQ13535 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
ATRQ13535 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
ATRQ13535 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
ATRQ13535 AP003419.4-201ENST00000616071 517 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
ATRQ13535 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
ATRQ13535 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
ATRQ13535 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
ATRQ13535 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
ATRQ13535 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
ATRQ13535 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
ATRQ13535 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
ATRQ13535 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
ATRQ13535 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
ATRQ13535 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
ATRQ13535 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
ATRQ13535 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
ATRQ13535 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
ATRQ13535 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
ATRQ13535 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
ATRQ13535 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
ATRQ13535 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
ATRQ13535 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
ATRQ13535 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
ATRQ13535 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
ATRQ13535 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
ATRQ13535 LINC01237-201ENST00000415434 573 ntTSL 4 BASIC12.68□□□□□ -0.38
ATRQ13535 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC12.68□□□□□ -0.38
ATRQ13535 MPZL3-203ENST00000525386 973 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
ATRQ13535 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC12.68□□□□□ -0.38
ATRQ13535 AC025154.2-203ENST00000550214 1031 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
ATRQ13535 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
ATRQ13535 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
ATRQ13535 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
ATRQ13535 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
ATRQ13535 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
ATRQ13535 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
ATRQ13535 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
ATRQ13535 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
ATRQ13535 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
ATRQ13535 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
ATRQ13535 ZNF581-203ENST00000587252 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
ATRQ13535 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
ATRQ13535 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
ATRQ13535 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
ATRQ13535 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
ATRQ13535 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
ATRQ13535 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
ATRQ13535 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
ATRQ13535 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
ATRQ13535 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
ATRQ13535 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
ATRQ13535 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
ATRQ13535 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
ATRQ13535 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
ATRQ13535 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
ATRQ13535 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
ATRQ13535 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
ATRQ13535 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
ATRQ13535 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
ATRQ13535 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
ATRQ13535 CCDC197-205ENST00000636493 1279 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
ATRQ13535 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
ATRQ13535 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
ATRQ13535 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
ATRQ13535 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
ATRQ13535 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
ATRQ13535 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
ATRQ13535 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
ATRQ13535 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
ATRQ13535 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
ATRQ13535 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
ATRQ13535 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
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