Protein–RNA interactions for Protein: Q13522

PPP1R1A, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 1A, humanhuman

Predictions only

Length 171 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R1AQ13522 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PPP1R1AQ13522 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PPP1R1AQ13522 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PPP1R1AQ13522 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PPP1R1AQ13522 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PPP1R1AQ13522 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PPP1R1AQ13522 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PPP1R1AQ13522 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PPP1R1AQ13522 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PPP1R1AQ13522 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PPP1R1AQ13522 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PPP1R1AQ13522 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PPP1R1AQ13522 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PPP1R1AQ13522 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PPP1R1AQ13522 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PPP1R1AQ13522 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PPP1R1AQ13522 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PPP1R1AQ13522 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PPP1R1AQ13522 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PPP1R1AQ13522 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PPP1R1AQ13522 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PPP1R1AQ13522 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PPP1R1AQ13522 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PPP1R1AQ13522 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PPP1R1AQ13522 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PPP1R1AQ13522 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PPP1R1AQ13522 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
PPP1R1AQ13522 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
PPP1R1AQ13522 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PPP1R1AQ13522 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PPP1R1AQ13522 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PPP1R1AQ13522 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PPP1R1AQ13522 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PPP1R1AQ13522 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PPP1R1AQ13522 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PPP1R1AQ13522 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PPP1R1AQ13522 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PPP1R1AQ13522 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PPP1R1AQ13522 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PPP1R1AQ13522 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PPP1R1AQ13522 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PPP1R1AQ13522 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PPP1R1AQ13522 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PPP1R1AQ13522 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PPP1R1AQ13522 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PPP1R1AQ13522 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PPP1R1AQ13522 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
PPP1R1AQ13522 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PPP1R1AQ13522 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PPP1R1AQ13522 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PPP1R1AQ13522 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PPP1R1AQ13522 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PPP1R1AQ13522 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
PPP1R1AQ13522 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PPP1R1AQ13522 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PPP1R1AQ13522 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PPP1R1AQ13522 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PPP1R1AQ13522 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PPP1R1AQ13522 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PPP1R1AQ13522 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PPP1R1AQ13522 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PPP1R1AQ13522 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
PPP1R1AQ13522 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PPP1R1AQ13522 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PPP1R1AQ13522 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PPP1R1AQ13522 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PPP1R1AQ13522 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PPP1R1AQ13522 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PPP1R1AQ13522 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PPP1R1AQ13522 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PPP1R1AQ13522 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PPP1R1AQ13522 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PPP1R1AQ13522 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
PPP1R1AQ13522 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PPP1R1AQ13522 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
PPP1R1AQ13522 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PPP1R1AQ13522 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PPP1R1AQ13522 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PPP1R1AQ13522 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PPP1R1AQ13522 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PPP1R1AQ13522 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PPP1R1AQ13522 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PPP1R1AQ13522 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PPP1R1AQ13522 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PPP1R1AQ13522 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PPP1R1AQ13522 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PPP1R1AQ13522 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PPP1R1AQ13522 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PPP1R1AQ13522 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PPP1R1AQ13522 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PPP1R1AQ13522 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PPP1R1AQ13522 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PPP1R1AQ13522 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PPP1R1AQ13522 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PPP1R1AQ13522 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PPP1R1AQ13522 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PPP1R1AQ13522 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PPP1R1AQ13522 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PPP1R1AQ13522 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PPP1R1AQ13522 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms