Protein–RNA interactions for Protein: Q13131

PRKAA1, 5'-AMP-activated protein kinase catalytic subunit alpha-1, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAA1Q13131 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRKAA1Q13131 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRKAA1Q13131 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRKAA1Q13131 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRKAA1Q13131 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRKAA1Q13131 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PRKAA1Q13131 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRKAA1Q13131 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRKAA1Q13131 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRKAA1Q13131 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRKAA1Q13131 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PRKAA1Q13131 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRKAA1Q13131 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PRKAA1Q13131 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRKAA1Q13131 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRKAA1Q13131 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PRKAA1Q13131 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRKAA1Q13131 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRKAA1Q13131 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PRKAA1Q13131 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRKAA1Q13131 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRKAA1Q13131 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRKAA1Q13131 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRKAA1Q13131 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRKAA1Q13131 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRKAA1Q13131 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRKAA1Q13131 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRKAA1Q13131 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRKAA1Q13131 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRKAA1Q13131 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRKAA1Q13131 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRKAA1Q13131 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRKAA1Q13131 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PRKAA1Q13131 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRKAA1Q13131 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRKAA1Q13131 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRKAA1Q13131 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRKAA1Q13131 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRKAA1Q13131 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRKAA1Q13131 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRKAA1Q13131 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRKAA1Q13131 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRKAA1Q13131 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRKAA1Q13131 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRKAA1Q13131 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PRKAA1Q13131 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRKAA1Q13131 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRKAA1Q13131 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRKAA1Q13131 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRKAA1Q13131 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRKAA1Q13131 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRKAA1Q13131 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRKAA1Q13131 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRKAA1Q13131 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRKAA1Q13131 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRKAA1Q13131 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
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PRKAA1Q13131 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
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PRKAA1Q13131 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PRKAA1Q13131 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRKAA1Q13131 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRKAA1Q13131 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PRKAA1Q13131 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRKAA1Q13131 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
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PRKAA1Q13131 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
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PRKAA1Q13131 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
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PRKAA1Q13131 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRKAA1Q13131 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
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PRKAA1Q13131 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRKAA1Q13131 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PRKAA1Q13131 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRKAA1Q13131 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
PRKAA1Q13131 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
PRKAA1Q13131 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PRKAA1Q13131 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRKAA1Q13131 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRKAA1Q13131 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRKAA1Q13131 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRKAA1Q13131 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRKAA1Q13131 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRKAA1Q13131 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRKAA1Q13131 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRKAA1Q13131 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRKAA1Q13131 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRKAA1Q13131 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRKAA1Q13131 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRKAA1Q13131 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRKAA1Q13131 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PRKAA1Q13131 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRKAA1Q13131 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PRKAA1Q13131 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRKAA1Q13131 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRKAA1Q13131 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
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