Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHAF1BQ13112 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHAF1BQ13112 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHAF1BQ13112 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHAF1BQ13112 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHAF1BQ13112 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHAF1BQ13112 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHAF1BQ13112 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHAF1BQ13112 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHAF1BQ13112 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHAF1BQ13112 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHAF1BQ13112 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHAF1BQ13112 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHAF1BQ13112 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHAF1BQ13112 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHAF1BQ13112 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHAF1BQ13112 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHAF1BQ13112 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHAF1BQ13112 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHAF1BQ13112 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHAF1BQ13112 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CHAF1BQ13112 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CHAF1BQ13112 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CHAF1BQ13112 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHAF1BQ13112 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHAF1BQ13112 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHAF1BQ13112 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHAF1BQ13112 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHAF1BQ13112 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHAF1BQ13112 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHAF1BQ13112 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CHAF1BQ13112 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHAF1BQ13112 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHAF1BQ13112 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHAF1BQ13112 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHAF1BQ13112 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHAF1BQ13112 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHAF1BQ13112 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHAF1BQ13112 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHAF1BQ13112 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHAF1BQ13112 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CHAF1BQ13112 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CHAF1BQ13112 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CHAF1BQ13112 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CHAF1BQ13112 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CHAF1BQ13112 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CHAF1BQ13112 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CHAF1BQ13112 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CHAF1BQ13112 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CHAF1BQ13112 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CHAF1BQ13112 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CHAF1BQ13112 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHAF1BQ13112 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHAF1BQ13112 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHAF1BQ13112 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHAF1BQ13112 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHAF1BQ13112 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHAF1BQ13112 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHAF1BQ13112 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHAF1BQ13112 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHAF1BQ13112 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHAF1BQ13112 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHAF1BQ13112 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CHAF1BQ13112 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHAF1BQ13112 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CHAF1BQ13112 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHAF1BQ13112 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHAF1BQ13112 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHAF1BQ13112 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CHAF1BQ13112 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHAF1BQ13112 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHAF1BQ13112 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHAF1BQ13112 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHAF1BQ13112 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHAF1BQ13112 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHAF1BQ13112 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHAF1BQ13112 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHAF1BQ13112 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHAF1BQ13112 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHAF1BQ13112 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHAF1BQ13112 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHAF1BQ13112 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHAF1BQ13112 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHAF1BQ13112 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHAF1BQ13112 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHAF1BQ13112 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHAF1BQ13112 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHAF1BQ13112 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHAF1BQ13112 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHAF1BQ13112 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHAF1BQ13112 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHAF1BQ13112 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHAF1BQ13112 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHAF1BQ13112 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHAF1BQ13112 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHAF1BQ13112 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHAF1BQ13112 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHAF1BQ13112 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHAF1BQ13112 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHAF1BQ13112 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
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