Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GPS1Q13098 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GPS1Q13098 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GPS1Q13098 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GPS1Q13098 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GPS1Q13098 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GPS1Q13098 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GPS1Q13098 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GPS1Q13098 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GPS1Q13098 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GPS1Q13098 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GPS1Q13098 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GPS1Q13098 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GPS1Q13098 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GPS1Q13098 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GPS1Q13098 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GPS1Q13098 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GPS1Q13098 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GPS1Q13098 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GPS1Q13098 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GPS1Q13098 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GPS1Q13098 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GPS1Q13098 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GPS1Q13098 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
GPS1Q13098 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
GPS1Q13098 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GPS1Q13098 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GPS1Q13098 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GPS1Q13098 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GPS1Q13098 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
GPS1Q13098 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
GPS1Q13098 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GPS1Q13098 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GPS1Q13098 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GPS1Q13098 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GPS1Q13098 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GPS1Q13098 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GPS1Q13098 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GPS1Q13098 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GPS1Q13098 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GPS1Q13098 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GPS1Q13098 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GPS1Q13098 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GPS1Q13098 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GPS1Q13098 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GPS1Q13098 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GPS1Q13098 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GPS1Q13098 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GPS1Q13098 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GPS1Q13098 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GPS1Q13098 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GPS1Q13098 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GPS1Q13098 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GPS1Q13098 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GPS1Q13098 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GPS1Q13098 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GPS1Q13098 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GPS1Q13098 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GPS1Q13098 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GPS1Q13098 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GPS1Q13098 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GPS1Q13098 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GPS1Q13098 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GPS1Q13098 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GPS1Q13098 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GPS1Q13098 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GPS1Q13098 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GPS1Q13098 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
GPS1Q13098 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GPS1Q13098 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GPS1Q13098 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
GPS1Q13098 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
GPS1Q13098 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GPS1Q13098 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GPS1Q13098 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GPS1Q13098 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GPS1Q13098 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GPS1Q13098 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GPS1Q13098 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GPS1Q13098 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GPS1Q13098 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GPS1Q13098 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GPS1Q13098 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
GPS1Q13098 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GPS1Q13098 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GPS1Q13098 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GPS1Q13098 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GPS1Q13098 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GPS1Q13098 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GPS1Q13098 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GPS1Q13098 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GPS1Q13098 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
GPS1Q13098 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GPS1Q13098 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GPS1Q13098 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GPS1Q13098 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GPS1Q13098 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GPS1Q13098 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GPS1Q13098 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GPS1Q13098 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
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