Protein–RNA interactions for Protein: Q13084

MRPL28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL28Q13084 IRAK3-201ENST00000261233 8663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
MRPL28Q13084 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
MRPL28Q13084 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
MRPL28Q13084 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
MRPL28Q13084 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
MRPL28Q13084 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
MRPL28Q13084 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
MRPL28Q13084 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
MRPL28Q13084 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
MRPL28Q13084 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
MRPL28Q13084 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
MRPL28Q13084 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
MRPL28Q13084 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
MRPL28Q13084 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
MRPL28Q13084 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
MRPL28Q13084 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
MRPL28Q13084 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
MRPL28Q13084 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
MRPL28Q13084 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
MRPL28Q13084 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
MRPL28Q13084 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
MRPL28Q13084 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
MRPL28Q13084 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
MRPL28Q13084 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
MRPL28Q13084 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
MRPL28Q13084 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
MRPL28Q13084 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
MRPL28Q13084 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
MRPL28Q13084 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
MRPL28Q13084 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
MRPL28Q13084 ADAMTS7P1-201ENST00000613213 4793 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
MRPL28Q13084 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
MRPL28Q13084 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
MRPL28Q13084 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
MRPL28Q13084 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
MRPL28Q13084 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
MRPL28Q13084 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
MRPL28Q13084 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
MRPL28Q13084 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
MRPL28Q13084 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
MRPL28Q13084 POM121-201ENST00000358357 5320 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
MRPL28Q13084 VGLL3-202ENST00000398399 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
MRPL28Q13084 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
MRPL28Q13084 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
MRPL28Q13084 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
MRPL28Q13084 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
MRPL28Q13084 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
MRPL28Q13084 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
MRPL28Q13084 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
MRPL28Q13084 KIRREL1-204ENST00000368173 7519 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
MRPL28Q13084 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.03
MRPL28Q13084 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
MRPL28Q13084 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
MRPL28Q13084 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
MRPL28Q13084 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
MRPL28Q13084 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
MRPL28Q13084 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
MRPL28Q13084 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
MRPL28Q13084 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
MRPL28Q13084 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
MRPL28Q13084 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
MRPL28Q13084 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
MRPL28Q13084 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
MRPL28Q13084 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
MRPL28Q13084 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
MRPL28Q13084 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
MRPL28Q13084 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
MRPL28Q13084 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
MRPL28Q13084 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
MRPL28Q13084 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
MRPL28Q13084 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
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MRPL28Q13084 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
MRPL28Q13084 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
MRPL28Q13084 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
MRPL28Q13084 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
MRPL28Q13084 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
MRPL28Q13084 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
MRPL28Q13084 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
MRPL28Q13084 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
MRPL28Q13084 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
MRPL28Q13084 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
MRPL28Q13084 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
MRPL28Q13084 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
MRPL28Q13084 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
MRPL28Q13084 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
MRPL28Q13084 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
MRPL28Q13084 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
MRPL28Q13084 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
MRPL28Q13084 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
MRPL28Q13084 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
MRPL28Q13084 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
MRPL28Q13084 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
MRPL28Q13084 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
MRPL28Q13084 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
MRPL28Q13084 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
MRPL28Q13084 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
MRPL28Q13084 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
MRPL28Q13084 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
MRPL28Q13084 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
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