Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

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Length 1,718 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PRDM2Q13029 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PRDM2Q13029 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PRDM2Q13029 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PRDM2Q13029 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PRDM2Q13029 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PRDM2Q13029 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PRDM2Q13029 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PRDM2Q13029 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PRDM2Q13029 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PRDM2Q13029 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PRDM2Q13029 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PRDM2Q13029 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PRDM2Q13029 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PRDM2Q13029 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PRDM2Q13029 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PRDM2Q13029 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PRDM2Q13029 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PRDM2Q13029 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PRDM2Q13029 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PRDM2Q13029 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PRDM2Q13029 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
PRDM2Q13029 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PRDM2Q13029 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PRDM2Q13029 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
PRDM2Q13029 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PRDM2Q13029 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PRDM2Q13029 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PRDM2Q13029 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PRDM2Q13029 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PRDM2Q13029 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
PRDM2Q13029 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
PRDM2Q13029 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PRDM2Q13029 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PRDM2Q13029 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PRDM2Q13029 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PRDM2Q13029 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PRDM2Q13029 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PRDM2Q13029 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
PRDM2Q13029 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PRDM2Q13029 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PRDM2Q13029 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PRDM2Q13029 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
PRDM2Q13029 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PRDM2Q13029 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PRDM2Q13029 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PRDM2Q13029 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PRDM2Q13029 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PRDM2Q13029 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PRDM2Q13029 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PRDM2Q13029 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PRDM2Q13029 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PRDM2Q13029 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PRDM2Q13029 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PRDM2Q13029 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
PRDM2Q13029 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PRDM2Q13029 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PRDM2Q13029 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PRDM2Q13029 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PRDM2Q13029 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
PRDM2Q13029 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
PRDM2Q13029 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PRDM2Q13029 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PRDM2Q13029 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PRDM2Q13029 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PRDM2Q13029 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PRDM2Q13029 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PRDM2Q13029 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PRDM2Q13029 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PRDM2Q13029 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PRDM2Q13029 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PRDM2Q13029 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PRDM2Q13029 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PRDM2Q13029 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PRDM2Q13029 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PRDM2Q13029 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PRDM2Q13029 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PRDM2Q13029 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
PRDM2Q13029 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PRDM2Q13029 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PRDM2Q13029 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PRDM2Q13029 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PRDM2Q13029 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PRDM2Q13029 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PRDM2Q13029 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PRDM2Q13029 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PRDM2Q13029 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PRDM2Q13029 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PRDM2Q13029 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PRDM2Q13029 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PRDM2Q13029 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
PRDM2Q13029 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PRDM2Q13029 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PRDM2Q13029 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PRDM2Q13029 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PRDM2Q13029 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PRDM2Q13029 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PRDM2Q13029 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PRDM2Q13029 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PRDM2Q13029 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
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