Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBBP4Q09028 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBBP4Q09028 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBBP4Q09028 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBBP4Q09028 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBBP4Q09028 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBBP4Q09028 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBBP4Q09028 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBBP4Q09028 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBBP4Q09028 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBBP4Q09028 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBBP4Q09028 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBBP4Q09028 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBBP4Q09028 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBBP4Q09028 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBBP4Q09028 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBBP4Q09028 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBBP4Q09028 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBBP4Q09028 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBBP4Q09028 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBBP4Q09028 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBBP4Q09028 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBBP4Q09028 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RBBP4Q09028 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBBP4Q09028 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBBP4Q09028 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBBP4Q09028 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBBP4Q09028 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBBP4Q09028 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBBP4Q09028 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBBP4Q09028 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBBP4Q09028 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBBP4Q09028 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBBP4Q09028 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBBP4Q09028 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBBP4Q09028 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RBBP4Q09028 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RBBP4Q09028 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RBBP4Q09028 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RBBP4Q09028 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RBBP4Q09028 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RBBP4Q09028 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RBBP4Q09028 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RBBP4Q09028 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RBBP4Q09028 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RBBP4Q09028 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RBBP4Q09028 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RBBP4Q09028 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RBBP4Q09028 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RBBP4Q09028 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RBBP4Q09028 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RBBP4Q09028 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RBBP4Q09028 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RBBP4Q09028 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RBBP4Q09028 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RBBP4Q09028 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RBBP4Q09028 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RBBP4Q09028 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RBBP4Q09028 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RBBP4Q09028 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RBBP4Q09028 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RBBP4Q09028 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RBBP4Q09028 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RBBP4Q09028 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RBBP4Q09028 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RBBP4Q09028 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RBBP4Q09028 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RBBP4Q09028 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RBBP4Q09028 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RBBP4Q09028 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RBBP4Q09028 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RBBP4Q09028 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RBBP4Q09028 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RBBP4Q09028 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RBBP4Q09028 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RBBP4Q09028 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RBBP4Q09028 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RBBP4Q09028 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RBBP4Q09028 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RBBP4Q09028 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RBBP4Q09028 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RBBP4Q09028 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RBBP4Q09028 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RBBP4Q09028 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RBBP4Q09028 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RBBP4Q09028 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RBBP4Q09028 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RBBP4Q09028 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RBBP4Q09028 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RBBP4Q09028 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RBBP4Q09028 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RBBP4Q09028 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RBBP4Q09028 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RBBP4Q09028 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RBBP4Q09028 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RBBP4Q09028 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RBBP4Q09028 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RBBP4Q09028 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RBBP4Q09028 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RBBP4Q09028 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms