Protein–RNA interactions for Protein: Q08AI8

C2orf54, Uncharacterized protein C2orf54, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf54Q08AI8 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
C2orf54Q08AI8 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
C2orf54Q08AI8 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
C2orf54Q08AI8 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
C2orf54Q08AI8 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
C2orf54Q08AI8 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
C2orf54Q08AI8 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
C2orf54Q08AI8 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
C2orf54Q08AI8 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
C2orf54Q08AI8 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
C2orf54Q08AI8 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
C2orf54Q08AI8 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
C2orf54Q08AI8 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
C2orf54Q08AI8 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
C2orf54Q08AI8 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
C2orf54Q08AI8 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
C2orf54Q08AI8 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
C2orf54Q08AI8 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
C2orf54Q08AI8 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
C2orf54Q08AI8 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
C2orf54Q08AI8 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
C2orf54Q08AI8 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
C2orf54Q08AI8 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
C2orf54Q08AI8 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
C2orf54Q08AI8 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
C2orf54Q08AI8 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
C2orf54Q08AI8 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
C2orf54Q08AI8 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
C2orf54Q08AI8 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
C2orf54Q08AI8 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
C2orf54Q08AI8 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
C2orf54Q08AI8 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
C2orf54Q08AI8 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
C2orf54Q08AI8 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
C2orf54Q08AI8 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
C2orf54Q08AI8 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
C2orf54Q08AI8 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
C2orf54Q08AI8 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
C2orf54Q08AI8 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
C2orf54Q08AI8 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
C2orf54Q08AI8 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
C2orf54Q08AI8 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
C2orf54Q08AI8 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
C2orf54Q08AI8 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
C2orf54Q08AI8 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
C2orf54Q08AI8 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
C2orf54Q08AI8 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
C2orf54Q08AI8 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
C2orf54Q08AI8 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
C2orf54Q08AI8 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
C2orf54Q08AI8 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
C2orf54Q08AI8 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
C2orf54Q08AI8 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
C2orf54Q08AI8 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
C2orf54Q08AI8 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
C2orf54Q08AI8 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
C2orf54Q08AI8 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
C2orf54Q08AI8 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
C2orf54Q08AI8 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
C2orf54Q08AI8 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
C2orf54Q08AI8 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
C2orf54Q08AI8 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
C2orf54Q08AI8 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
C2orf54Q08AI8 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
C2orf54Q08AI8 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
C2orf54Q08AI8 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
C2orf54Q08AI8 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
C2orf54Q08AI8 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
C2orf54Q08AI8 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C2orf54Q08AI8 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C2orf54Q08AI8 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
C2orf54Q08AI8 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C2orf54Q08AI8 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C2orf54Q08AI8 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C2orf54Q08AI8 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C2orf54Q08AI8 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C2orf54Q08AI8 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C2orf54Q08AI8 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C2orf54Q08AI8 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
C2orf54Q08AI8 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
C2orf54Q08AI8 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C2orf54Q08AI8 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C2orf54Q08AI8 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
C2orf54Q08AI8 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
C2orf54Q08AI8 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C2orf54Q08AI8 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
C2orf54Q08AI8 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
C2orf54Q08AI8 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
C2orf54Q08AI8 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
C2orf54Q08AI8 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
C2orf54Q08AI8 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
C2orf54Q08AI8 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
C2orf54Q08AI8 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
C2orf54Q08AI8 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
C2orf54Q08AI8 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
C2orf54Q08AI8 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C2orf54Q08AI8 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
C2orf54Q08AI8 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
C2orf54Q08AI8 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
C2orf54Q08AI8 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.7 ms