Protein–RNA interactions for Protein: Q08AF3

SLFN5, Schlafen family member 5, humanhuman

Predictions only

Length 891 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFN5Q08AF3 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLFN5Q08AF3 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLFN5Q08AF3 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLFN5Q08AF3 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLFN5Q08AF3 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLFN5Q08AF3 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLFN5Q08AF3 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLFN5Q08AF3 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLFN5Q08AF3 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SLFN5Q08AF3 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SLFN5Q08AF3 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SLFN5Q08AF3 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SLFN5Q08AF3 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLFN5Q08AF3 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLFN5Q08AF3 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLFN5Q08AF3 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLFN5Q08AF3 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLFN5Q08AF3 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLFN5Q08AF3 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLFN5Q08AF3 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLFN5Q08AF3 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLFN5Q08AF3 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLFN5Q08AF3 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLFN5Q08AF3 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
SLFN5Q08AF3 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLFN5Q08AF3 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLFN5Q08AF3 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
SLFN5Q08AF3 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLFN5Q08AF3 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLFN5Q08AF3 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLFN5Q08AF3 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLFN5Q08AF3 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLFN5Q08AF3 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLFN5Q08AF3 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLFN5Q08AF3 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLFN5Q08AF3 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLFN5Q08AF3 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLFN5Q08AF3 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLFN5Q08AF3 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLFN5Q08AF3 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLFN5Q08AF3 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLFN5Q08AF3 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLFN5Q08AF3 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLFN5Q08AF3 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLFN5Q08AF3 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLFN5Q08AF3 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLFN5Q08AF3 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLFN5Q08AF3 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLFN5Q08AF3 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLFN5Q08AF3 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLFN5Q08AF3 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLFN5Q08AF3 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLFN5Q08AF3 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLFN5Q08AF3 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SLFN5Q08AF3 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLFN5Q08AF3 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLFN5Q08AF3 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLFN5Q08AF3 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLFN5Q08AF3 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SLFN5Q08AF3 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLFN5Q08AF3 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLFN5Q08AF3 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SLFN5Q08AF3 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLFN5Q08AF3 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SLFN5Q08AF3 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLFN5Q08AF3 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLFN5Q08AF3 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLFN5Q08AF3 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLFN5Q08AF3 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLFN5Q08AF3 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLFN5Q08AF3 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLFN5Q08AF3 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLFN5Q08AF3 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLFN5Q08AF3 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLFN5Q08AF3 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLFN5Q08AF3 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLFN5Q08AF3 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLFN5Q08AF3 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLFN5Q08AF3 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLFN5Q08AF3 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLFN5Q08AF3 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLFN5Q08AF3 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLFN5Q08AF3 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLFN5Q08AF3 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLFN5Q08AF3 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLFN5Q08AF3 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLFN5Q08AF3 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLFN5Q08AF3 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLFN5Q08AF3 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLFN5Q08AF3 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLFN5Q08AF3 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLFN5Q08AF3 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLFN5Q08AF3 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLFN5Q08AF3 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLFN5Q08AF3 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLFN5Q08AF3 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLFN5Q08AF3 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLFN5Q08AF3 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SLFN5Q08AF3 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLFN5Q08AF3 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms