Protein–RNA interactions for Protein: Q07343

PDE4B, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4B, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4BQ07343 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PDE4BQ07343 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PDE4BQ07343 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PDE4BQ07343 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PDE4BQ07343 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PDE4BQ07343 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PDE4BQ07343 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PDE4BQ07343 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PDE4BQ07343 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PDE4BQ07343 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PDE4BQ07343 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PDE4BQ07343 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PDE4BQ07343 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PDE4BQ07343 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PDE4BQ07343 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PDE4BQ07343 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PDE4BQ07343 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PDE4BQ07343 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PDE4BQ07343 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PDE4BQ07343 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PDE4BQ07343 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PDE4BQ07343 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PDE4BQ07343 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PDE4BQ07343 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PDE4BQ07343 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PDE4BQ07343 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PDE4BQ07343 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PDE4BQ07343 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PDE4BQ07343 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PDE4BQ07343 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PDE4BQ07343 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PDE4BQ07343 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PDE4BQ07343 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PDE4BQ07343 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PDE4BQ07343 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PDE4BQ07343 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PDE4BQ07343 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PDE4BQ07343 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PDE4BQ07343 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PDE4BQ07343 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PDE4BQ07343 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PDE4BQ07343 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PDE4BQ07343 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PDE4BQ07343 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PDE4BQ07343 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PDE4BQ07343 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PDE4BQ07343 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PDE4BQ07343 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PDE4BQ07343 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PDE4BQ07343 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PDE4BQ07343 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
PDE4BQ07343 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PDE4BQ07343 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PDE4BQ07343 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PDE4BQ07343 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PDE4BQ07343 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PDE4BQ07343 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PDE4BQ07343 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PDE4BQ07343 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PDE4BQ07343 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
PDE4BQ07343 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PDE4BQ07343 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
PDE4BQ07343 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PDE4BQ07343 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PDE4BQ07343 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PDE4BQ07343 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PDE4BQ07343 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PDE4BQ07343 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PDE4BQ07343 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PDE4BQ07343 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PDE4BQ07343 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PDE4BQ07343 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PDE4BQ07343 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PDE4BQ07343 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PDE4BQ07343 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PDE4BQ07343 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PDE4BQ07343 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PDE4BQ07343 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
PDE4BQ07343 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PDE4BQ07343 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PDE4BQ07343 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PDE4BQ07343 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PDE4BQ07343 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PDE4BQ07343 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PDE4BQ07343 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PDE4BQ07343 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PDE4BQ07343 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PDE4BQ07343 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PDE4BQ07343 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PDE4BQ07343 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PDE4BQ07343 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PDE4BQ07343 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PDE4BQ07343 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PDE4BQ07343 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PDE4BQ07343 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PDE4BQ07343 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PDE4BQ07343 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PDE4BQ07343 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
PDE4BQ07343 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PDE4BQ07343 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms