Protein–RNA interactions for Protein: Q06609

RAD51, DNA repair protein RAD51 homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD51Q06609 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAD51Q06609 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAD51Q06609 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAD51Q06609 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAD51Q06609 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAD51Q06609 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAD51Q06609 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAD51Q06609 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
RAD51Q06609 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
RAD51Q06609 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
RAD51Q06609 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAD51Q06609 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAD51Q06609 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
RAD51Q06609 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
RAD51Q06609 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAD51Q06609 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAD51Q06609 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAD51Q06609 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAD51Q06609 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAD51Q06609 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAD51Q06609 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAD51Q06609 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAD51Q06609 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAD51Q06609 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAD51Q06609 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAD51Q06609 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
RAD51Q06609 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAD51Q06609 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAD51Q06609 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAD51Q06609 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAD51Q06609 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAD51Q06609 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAD51Q06609 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAD51Q06609 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAD51Q06609 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAD51Q06609 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAD51Q06609 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
RAD51Q06609 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAD51Q06609 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAD51Q06609 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAD51Q06609 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
RAD51Q06609 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAD51Q06609 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAD51Q06609 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAD51Q06609 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
RAD51Q06609 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAD51Q06609 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAD51Q06609 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAD51Q06609 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAD51Q06609 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAD51Q06609 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
RAD51Q06609 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
RAD51Q06609 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAD51Q06609 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAD51Q06609 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAD51Q06609 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAD51Q06609 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAD51Q06609 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAD51Q06609 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAD51Q06609 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAD51Q06609 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAD51Q06609 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
RAD51Q06609 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAD51Q06609 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAD51Q06609 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAD51Q06609 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAD51Q06609 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAD51Q06609 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAD51Q06609 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAD51Q06609 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAD51Q06609 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAD51Q06609 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAD51Q06609 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAD51Q06609 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAD51Q06609 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAD51Q06609 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAD51Q06609 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAD51Q06609 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAD51Q06609 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAD51Q06609 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAD51Q06609 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAD51Q06609 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAD51Q06609 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAD51Q06609 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAD51Q06609 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAD51Q06609 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAD51Q06609 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAD51Q06609 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAD51Q06609 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
RAD51Q06609 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAD51Q06609 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
RAD51Q06609 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAD51Q06609 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAD51Q06609 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAD51Q06609 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
RAD51Q06609 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
RAD51Q06609 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAD51Q06609 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAD51Q06609 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAD51Q06609 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms