Protein–RNA interactions for Protein: Q03188

CENPC, Centromere protein C, humanhuman

Predictions only

Length 943 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPCQ03188 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CENPCQ03188 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CENPCQ03188 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CENPCQ03188 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CENPCQ03188 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CENPCQ03188 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CENPCQ03188 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CENPCQ03188 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CENPCQ03188 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CENPCQ03188 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CENPCQ03188 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CENPCQ03188 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CENPCQ03188 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CENPCQ03188 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CENPCQ03188 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CENPCQ03188 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CENPCQ03188 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CENPCQ03188 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CENPCQ03188 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CENPCQ03188 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CENPCQ03188 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CENPCQ03188 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CENPCQ03188 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CENPCQ03188 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CENPCQ03188 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CENPCQ03188 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CENPCQ03188 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CENPCQ03188 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CENPCQ03188 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CENPCQ03188 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CENPCQ03188 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CENPCQ03188 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CENPCQ03188 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CENPCQ03188 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CENPCQ03188 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CENPCQ03188 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CENPCQ03188 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CENPCQ03188 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CENPCQ03188 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CENPCQ03188 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CENPCQ03188 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CENPCQ03188 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CENPCQ03188 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CENPCQ03188 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CENPCQ03188 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CENPCQ03188 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CENPCQ03188 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CENPCQ03188 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CENPCQ03188 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CENPCQ03188 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CENPCQ03188 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CENPCQ03188 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CENPCQ03188 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CENPCQ03188 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CENPCQ03188 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CENPCQ03188 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CENPCQ03188 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CENPCQ03188 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CENPCQ03188 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CENPCQ03188 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CENPCQ03188 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CENPCQ03188 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
CENPCQ03188 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CENPCQ03188 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CENPCQ03188 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CENPCQ03188 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
CENPCQ03188 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CENPCQ03188 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CENPCQ03188 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CENPCQ03188 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CENPCQ03188 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CENPCQ03188 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CENPCQ03188 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CENPCQ03188 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CENPCQ03188 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CENPCQ03188 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CENPCQ03188 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CENPCQ03188 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CENPCQ03188 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CENPCQ03188 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CENPCQ03188 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CENPCQ03188 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CENPCQ03188 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CENPCQ03188 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CENPCQ03188 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CENPCQ03188 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CENPCQ03188 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CENPCQ03188 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CENPCQ03188 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CENPCQ03188 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CENPCQ03188 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CENPCQ03188 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CENPCQ03188 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CENPCQ03188 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CENPCQ03188 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CENPCQ03188 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CENPCQ03188 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CENPCQ03188 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CENPCQ03188 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CENPCQ03188 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms