Protein–RNA interactions for Protein: Q03181

PPARD, Peroxisome proliferator-activated receptor delta, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARDQ03181 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PPARDQ03181 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PPARDQ03181 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PPARDQ03181 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PPARDQ03181 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
PPARDQ03181 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PPARDQ03181 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PPARDQ03181 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
PPARDQ03181 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PPARDQ03181 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PPARDQ03181 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PPARDQ03181 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PPARDQ03181 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PPARDQ03181 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PPARDQ03181 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PPARDQ03181 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PPARDQ03181 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
PPARDQ03181 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PPARDQ03181 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
PPARDQ03181 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
PPARDQ03181 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PPARDQ03181 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PPARDQ03181 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PPARDQ03181 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PPARDQ03181 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PPARDQ03181 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
PPARDQ03181 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PPARDQ03181 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PPARDQ03181 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PPARDQ03181 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PPARDQ03181 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PPARDQ03181 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PPARDQ03181 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PPARDQ03181 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PPARDQ03181 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
PPARDQ03181 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PPARDQ03181 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PPARDQ03181 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PPARDQ03181 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PPARDQ03181 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PPARDQ03181 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PPARDQ03181 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PPARDQ03181 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
PPARDQ03181 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PPARDQ03181 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PPARDQ03181 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PPARDQ03181 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PPARDQ03181 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PPARDQ03181 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
PPARDQ03181 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PPARDQ03181 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PPARDQ03181 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PPARDQ03181 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PPARDQ03181 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PPARDQ03181 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PPARDQ03181 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PPARDQ03181 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PPARDQ03181 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PPARDQ03181 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PPARDQ03181 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PPARDQ03181 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PPARDQ03181 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PPARDQ03181 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PPARDQ03181 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PPARDQ03181 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PPARDQ03181 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PPARDQ03181 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PPARDQ03181 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PPARDQ03181 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PPARDQ03181 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PPARDQ03181 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PPARDQ03181 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PPARDQ03181 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PPARDQ03181 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PPARDQ03181 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PPARDQ03181 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PPARDQ03181 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PPARDQ03181 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PPARDQ03181 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PPARDQ03181 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PPARDQ03181 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PPARDQ03181 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PPARDQ03181 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PPARDQ03181 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PPARDQ03181 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PPARDQ03181 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PPARDQ03181 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PPARDQ03181 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PPARDQ03181 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PPARDQ03181 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PPARDQ03181 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PPARDQ03181 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PPARDQ03181 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PPARDQ03181 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PPARDQ03181 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PPARDQ03181 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PPARDQ03181 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PPARDQ03181 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PPARDQ03181 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PPARDQ03181 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.6 ms