Protein–RNA interactions for Protein: Q02809

PLOD1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLOD1Q02809 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PLOD1Q02809 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PLOD1Q02809 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PLOD1Q02809 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PLOD1Q02809 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PLOD1Q02809 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PLOD1Q02809 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PLOD1Q02809 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PLOD1Q02809 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PLOD1Q02809 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PLOD1Q02809 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PLOD1Q02809 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PLOD1Q02809 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PLOD1Q02809 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PLOD1Q02809 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PLOD1Q02809 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PLOD1Q02809 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PLOD1Q02809 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PLOD1Q02809 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PLOD1Q02809 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PLOD1Q02809 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PLOD1Q02809 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PLOD1Q02809 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PLOD1Q02809 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PLOD1Q02809 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PLOD1Q02809 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PLOD1Q02809 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PLOD1Q02809 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PLOD1Q02809 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PLOD1Q02809 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PLOD1Q02809 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PLOD1Q02809 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PLOD1Q02809 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PLOD1Q02809 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PLOD1Q02809 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PLOD1Q02809 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PLOD1Q02809 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PLOD1Q02809 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PLOD1Q02809 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PLOD1Q02809 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PLOD1Q02809 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PLOD1Q02809 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PLOD1Q02809 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PLOD1Q02809 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PLOD1Q02809 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PLOD1Q02809 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PLOD1Q02809 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PLOD1Q02809 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PLOD1Q02809 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PLOD1Q02809 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PLOD1Q02809 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PLOD1Q02809 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PLOD1Q02809 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PLOD1Q02809 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PLOD1Q02809 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PLOD1Q02809 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PLOD1Q02809 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PLOD1Q02809 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PLOD1Q02809 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PLOD1Q02809 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PLOD1Q02809 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PLOD1Q02809 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PLOD1Q02809 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PLOD1Q02809 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PLOD1Q02809 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PLOD1Q02809 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PLOD1Q02809 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PLOD1Q02809 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PLOD1Q02809 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PLOD1Q02809 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PLOD1Q02809 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PLOD1Q02809 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PLOD1Q02809 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PLOD1Q02809 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PLOD1Q02809 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PLOD1Q02809 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PLOD1Q02809 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PLOD1Q02809 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PLOD1Q02809 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PLOD1Q02809 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
PLOD1Q02809 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PLOD1Q02809 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PLOD1Q02809 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PLOD1Q02809 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PLOD1Q02809 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PLOD1Q02809 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PLOD1Q02809 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PLOD1Q02809 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PLOD1Q02809 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PLOD1Q02809 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PLOD1Q02809 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PLOD1Q02809 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PLOD1Q02809 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PLOD1Q02809 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PLOD1Q02809 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PLOD1Q02809 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PLOD1Q02809 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PLOD1Q02809 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PLOD1Q02809 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PLOD1Q02809 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms