Protein–RNA interactions for Protein: P98173

FAM3A, Protein FAM3A, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3AP98173 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
FAM3AP98173 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
FAM3AP98173 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
FAM3AP98173 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
FAM3AP98173 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC14.23□□□□□ -0.13
FAM3AP98173 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
FAM3AP98173 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
FAM3AP98173 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
FAM3AP98173 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
FAM3AP98173 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
FAM3AP98173 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
FAM3AP98173 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
FAM3AP98173 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
FAM3AP98173 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
FAM3AP98173 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
FAM3AP98173 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
FAM3AP98173 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
FAM3AP98173 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
FAM3AP98173 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
FAM3AP98173 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
FAM3AP98173 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
FAM3AP98173 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
FAM3AP98173 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
FAM3AP98173 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
FAM3AP98173 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
FAM3AP98173 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
FAM3AP98173 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
FAM3AP98173 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
FAM3AP98173 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
FAM3AP98173 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
FAM3AP98173 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
FAM3AP98173 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
FAM3AP98173 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
FAM3AP98173 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
FAM3AP98173 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
FAM3AP98173 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
FAM3AP98173 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
FAM3AP98173 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
FAM3AP98173 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
FAM3AP98173 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
FAM3AP98173 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
FAM3AP98173 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
FAM3AP98173 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
FAM3AP98173 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
FAM3AP98173 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
FAM3AP98173 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC14.22□□□□□ -0.13
FAM3AP98173 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
FAM3AP98173 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
FAM3AP98173 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC14.22□□□□□ -0.13
FAM3AP98173 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
FAM3AP98173 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
FAM3AP98173 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC14.22□□□□□ -0.13
FAM3AP98173 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
FAM3AP98173 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
FAM3AP98173 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
FAM3AP98173 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
FAM3AP98173 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
FAM3AP98173 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
FAM3AP98173 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
FAM3AP98173 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
FAM3AP98173 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
FAM3AP98173 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
FAM3AP98173 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
FAM3AP98173 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
FAM3AP98173 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
FAM3AP98173 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
FAM3AP98173 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
FAM3AP98173 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
FAM3AP98173 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
FAM3AP98173 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
FAM3AP98173 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
FAM3AP98173 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
FAM3AP98173 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
FAM3AP98173 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
FAM3AP98173 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
FAM3AP98173 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
FAM3AP98173 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
FAM3AP98173 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
FAM3AP98173 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
FAM3AP98173 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
FAM3AP98173 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
FAM3AP98173 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
FAM3AP98173 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
FAM3AP98173 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
FAM3AP98173 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
FAM3AP98173 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
FAM3AP98173 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
FAM3AP98173 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
FAM3AP98173 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
FAM3AP98173 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
FAM3AP98173 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
FAM3AP98173 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
FAM3AP98173 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
FAM3AP98173 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
FAM3AP98173 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
FAM3AP98173 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
FAM3AP98173 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
FAM3AP98173 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
FAM3AP98173 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
FAM3AP98173 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms