Protein–RNA interactions for Protein: P68371

TUBB4B, Tubulin beta-4B chain, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB4BP68371 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TUBB4BP68371 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TUBB4BP68371 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TUBB4BP68371 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TUBB4BP68371 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TUBB4BP68371 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TUBB4BP68371 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
TUBB4BP68371 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TUBB4BP68371 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TUBB4BP68371 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TUBB4BP68371 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TUBB4BP68371 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TUBB4BP68371 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TUBB4BP68371 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TUBB4BP68371 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TUBB4BP68371 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TUBB4BP68371 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TUBB4BP68371 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TUBB4BP68371 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TUBB4BP68371 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TUBB4BP68371 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TUBB4BP68371 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
TUBB4BP68371 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TUBB4BP68371 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TUBB4BP68371 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TUBB4BP68371 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TUBB4BP68371 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TUBB4BP68371 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TUBB4BP68371 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TUBB4BP68371 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TUBB4BP68371 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TUBB4BP68371 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TUBB4BP68371 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TUBB4BP68371 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TUBB4BP68371 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TUBB4BP68371 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TUBB4BP68371 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TUBB4BP68371 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TUBB4BP68371 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TUBB4BP68371 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TUBB4BP68371 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TUBB4BP68371 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TUBB4BP68371 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TUBB4BP68371 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TUBB4BP68371 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TUBB4BP68371 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TUBB4BP68371 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TUBB4BP68371 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TUBB4BP68371 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TUBB4BP68371 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TUBB4BP68371 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TUBB4BP68371 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TUBB4BP68371 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TUBB4BP68371 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TUBB4BP68371 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TUBB4BP68371 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TUBB4BP68371 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TUBB4BP68371 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
TUBB4BP68371 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
TUBB4BP68371 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TUBB4BP68371 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
TUBB4BP68371 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TUBB4BP68371 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TUBB4BP68371 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TUBB4BP68371 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TUBB4BP68371 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TUBB4BP68371 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TUBB4BP68371 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TUBB4BP68371 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TUBB4BP68371 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TUBB4BP68371 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TUBB4BP68371 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TUBB4BP68371 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TUBB4BP68371 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TUBB4BP68371 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TUBB4BP68371 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TUBB4BP68371 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TUBB4BP68371 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TUBB4BP68371 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TUBB4BP68371 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TUBB4BP68371 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
TUBB4BP68371 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TUBB4BP68371 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TUBB4BP68371 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
TUBB4BP68371 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TUBB4BP68371 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TUBB4BP68371 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TUBB4BP68371 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TUBB4BP68371 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TUBB4BP68371 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TUBB4BP68371 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TUBB4BP68371 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TUBB4BP68371 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TUBB4BP68371 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TUBB4BP68371 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TUBB4BP68371 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TUBB4BP68371 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TUBB4BP68371 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TUBB4BP68371 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TUBB4BP68371 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms