Protein–RNA interactions for Protein: P67870

CSNK2B, Casein kinase II subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2BP67870 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CSNK2BP67870 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CSNK2BP67870 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CSNK2BP67870 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CSNK2BP67870 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CSNK2BP67870 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CSNK2BP67870 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CSNK2BP67870 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSNK2BP67870 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSNK2BP67870 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSNK2BP67870 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CSNK2BP67870 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSNK2BP67870 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CSNK2BP67870 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSNK2BP67870 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CSNK2BP67870 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSNK2BP67870 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSNK2BP67870 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CSNK2BP67870 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CSNK2BP67870 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSNK2BP67870 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSNK2BP67870 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CSNK2BP67870 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSNK2BP67870 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSNK2BP67870 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CSNK2BP67870 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CSNK2BP67870 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CSNK2BP67870 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CSNK2BP67870 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CSNK2BP67870 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSNK2BP67870 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSNK2BP67870 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CSNK2BP67870 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CSNK2BP67870 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSNK2BP67870 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CSNK2BP67870 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSNK2BP67870 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CSNK2BP67870 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSNK2BP67870 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CSNK2BP67870 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSNK2BP67870 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSNK2BP67870 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CSNK2BP67870 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSNK2BP67870 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSNK2BP67870 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSNK2BP67870 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CSNK2BP67870 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CSNK2BP67870 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSNK2BP67870 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CSNK2BP67870 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CSNK2BP67870 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CSNK2BP67870 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CSNK2BP67870 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CSNK2BP67870 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CSNK2BP67870 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CSNK2BP67870 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CSNK2BP67870 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CSNK2BP67870 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CSNK2BP67870 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CSNK2BP67870 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CSNK2BP67870 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CSNK2BP67870 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CSNK2BP67870 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CSNK2BP67870 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CSNK2BP67870 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
CSNK2BP67870 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CSNK2BP67870 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CSNK2BP67870 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CSNK2BP67870 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CSNK2BP67870 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CSNK2BP67870 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CSNK2BP67870 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CSNK2BP67870 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CSNK2BP67870 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CSNK2BP67870 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CSNK2BP67870 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
CSNK2BP67870 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CSNK2BP67870 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CSNK2BP67870 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CSNK2BP67870 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CSNK2BP67870 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CSNK2BP67870 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CSNK2BP67870 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CSNK2BP67870 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CSNK2BP67870 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CSNK2BP67870 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CSNK2BP67870 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CSNK2BP67870 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CSNK2BP67870 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CSNK2BP67870 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CSNK2BP67870 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CSNK2BP67870 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CSNK2BP67870 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CSNK2BP67870 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CSNK2BP67870 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CSNK2BP67870 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CSNK2BP67870 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CSNK2BP67870 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CSNK2BP67870 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CSNK2BP67870 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms