Protein–RNA interactions for Protein: P57775

FBXW4, F-box/WD repeat-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXW4P57775 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FBXW4P57775 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FBXW4P57775 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FBXW4P57775 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FBXW4P57775 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FBXW4P57775 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
FBXW4P57775 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FBXW4P57775 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FBXW4P57775 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FBXW4P57775 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FBXW4P57775 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FBXW4P57775 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FBXW4P57775 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FBXW4P57775 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FBXW4P57775 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FBXW4P57775 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FBXW4P57775 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FBXW4P57775 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FBXW4P57775 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FBXW4P57775 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FBXW4P57775 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FBXW4P57775 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FBXW4P57775 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FBXW4P57775 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FBXW4P57775 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FBXW4P57775 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FBXW4P57775 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FBXW4P57775 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FBXW4P57775 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FBXW4P57775 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FBXW4P57775 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FBXW4P57775 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FBXW4P57775 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FBXW4P57775 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FBXW4P57775 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FBXW4P57775 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FBXW4P57775 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FBXW4P57775 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
FBXW4P57775 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FBXW4P57775 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FBXW4P57775 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FBXW4P57775 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FBXW4P57775 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FBXW4P57775 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FBXW4P57775 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FBXW4P57775 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FBXW4P57775 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FBXW4P57775 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FBXW4P57775 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
FBXW4P57775 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FBXW4P57775 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FBXW4P57775 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FBXW4P57775 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FBXW4P57775 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FBXW4P57775 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FBXW4P57775 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FBXW4P57775 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
FBXW4P57775 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FBXW4P57775 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
FBXW4P57775 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FBXW4P57775 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FBXW4P57775 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FBXW4P57775 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
FBXW4P57775 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FBXW4P57775 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FBXW4P57775 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FBXW4P57775 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
FBXW4P57775 PLIN4-202ENST00000633942 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FBXW4P57775 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FBXW4P57775 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FBXW4P57775 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FBXW4P57775 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FBXW4P57775 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FBXW4P57775 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FBXW4P57775 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FBXW4P57775 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FBXW4P57775 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
FBXW4P57775 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
FBXW4P57775 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FBXW4P57775 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FBXW4P57775 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FBXW4P57775 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FBXW4P57775 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
FBXW4P57775 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FBXW4P57775 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FBXW4P57775 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FBXW4P57775 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
FBXW4P57775 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FBXW4P57775 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FBXW4P57775 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FBXW4P57775 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FBXW4P57775 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FBXW4P57775 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FBXW4P57775 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FBXW4P57775 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FBXW4P57775 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FBXW4P57775 UBE3A-204ENST00000438097 8939 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FBXW4P57775 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FBXW4P57775 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FBXW4P57775 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms