Protein–RNA interactions for Protein: P57773

GJA9, Gap junction alpha-9 protein, humanhuman

Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA9P57773 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GJA9P57773 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
GJA9P57773 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
GJA9P57773 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC18■□□□□ 0.47
GJA9P57773 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
GJA9P57773 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
GJA9P57773 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GJA9P57773 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GJA9P57773 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC18■□□□□ 0.47
GJA9P57773 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GJA9P57773 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GJA9P57773 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GJA9P57773 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GJA9P57773 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GJA9P57773 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GJA9P57773 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GJA9P57773 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GJA9P57773 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GJA9P57773 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GJA9P57773 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GJA9P57773 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GJA9P57773 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GJA9P57773 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GJA9P57773 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GJA9P57773 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GJA9P57773 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GJA9P57773 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GJA9P57773 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GJA9P57773 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
GJA9P57773 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GJA9P57773 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GJA9P57773 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GJA9P57773 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GJA9P57773 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GJA9P57773 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GJA9P57773 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GJA9P57773 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GJA9P57773 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GJA9P57773 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GJA9P57773 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GJA9P57773 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GJA9P57773 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GJA9P57773 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GJA9P57773 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GJA9P57773 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GJA9P57773 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GJA9P57773 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GJA9P57773 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
GJA9P57773 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GJA9P57773 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GJA9P57773 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GJA9P57773 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GJA9P57773 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GJA9P57773 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GJA9P57773 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GJA9P57773 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GJA9P57773 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GJA9P57773 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GJA9P57773 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GJA9P57773 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GJA9P57773 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GJA9P57773 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GJA9P57773 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GJA9P57773 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
GJA9P57773 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GJA9P57773 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GJA9P57773 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GJA9P57773 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GJA9P57773 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
GJA9P57773 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GJA9P57773 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GJA9P57773 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GJA9P57773 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GJA9P57773 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GJA9P57773 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GJA9P57773 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GJA9P57773 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GJA9P57773 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GJA9P57773 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GJA9P57773 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GJA9P57773 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GJA9P57773 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GJA9P57773 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GJA9P57773 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GJA9P57773 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GJA9P57773 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GJA9P57773 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GJA9P57773 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GJA9P57773 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GJA9P57773 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GJA9P57773 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GJA9P57773 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GJA9P57773 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GJA9P57773 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GJA9P57773 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GJA9P57773 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GJA9P57773 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GJA9P57773 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GJA9P57773 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GJA9P57773 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms