Protein–RNA interactions for Protein: P55211

CASP9, Caspase-9, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP9P55211 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CASP9P55211 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CASP9P55211 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CASP9P55211 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CASP9P55211 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CASP9P55211 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CASP9P55211 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CASP9P55211 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CASP9P55211 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CASP9P55211 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CASP9P55211 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CASP9P55211 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CASP9P55211 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CASP9P55211 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CASP9P55211 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CASP9P55211 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CASP9P55211 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CASP9P55211 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CASP9P55211 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CASP9P55211 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CASP9P55211 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CASP9P55211 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CASP9P55211 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CASP9P55211 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CASP9P55211 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CASP9P55211 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CASP9P55211 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CASP9P55211 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CASP9P55211 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CASP9P55211 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CASP9P55211 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CASP9P55211 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CASP9P55211 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CASP9P55211 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CASP9P55211 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CASP9P55211 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CASP9P55211 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CASP9P55211 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CASP9P55211 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CASP9P55211 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CASP9P55211 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CASP9P55211 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CASP9P55211 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CASP9P55211 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CASP9P55211 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CASP9P55211 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CASP9P55211 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CASP9P55211 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CASP9P55211 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CASP9P55211 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CASP9P55211 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CASP9P55211 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CASP9P55211 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CASP9P55211 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CASP9P55211 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CASP9P55211 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CASP9P55211 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CASP9P55211 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CASP9P55211 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CASP9P55211 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CASP9P55211 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CASP9P55211 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CASP9P55211 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CASP9P55211 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CASP9P55211 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CASP9P55211 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CASP9P55211 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CASP9P55211 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CASP9P55211 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CASP9P55211 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CASP9P55211 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CASP9P55211 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CASP9P55211 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CASP9P55211 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CASP9P55211 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CASP9P55211 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CASP9P55211 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CASP9P55211 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CASP9P55211 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CASP9P55211 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CASP9P55211 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CASP9P55211 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CASP9P55211 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CASP9P55211 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CASP9P55211 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CASP9P55211 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CASP9P55211 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CASP9P55211 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CASP9P55211 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CASP9P55211 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CASP9P55211 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CASP9P55211 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CASP9P55211 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CASP9P55211 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CASP9P55211 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CASP9P55211 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CASP9P55211 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CASP9P55211 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CASP9P55211 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CASP9P55211 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms