Protein–RNA interactions for Protein: P52742

ZNF135, Zinc finger protein 135, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 658 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF135P52742 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZNF135P52742 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZNF135P52742 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZNF135P52742 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZNF135P52742 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZNF135P52742 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZNF135P52742 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZNF135P52742 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
ZNF135P52742 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZNF135P52742 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZNF135P52742 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZNF135P52742 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZNF135P52742 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZNF135P52742 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZNF135P52742 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZNF135P52742 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZNF135P52742 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZNF135P52742 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZNF135P52742 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZNF135P52742 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZNF135P52742 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZNF135P52742 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZNF135P52742 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZNF135P52742 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZNF135P52742 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZNF135P52742 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZNF135P52742 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZNF135P52742 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZNF135P52742 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZNF135P52742 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZNF135P52742 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZNF135P52742 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZNF135P52742 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZNF135P52742 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZNF135P52742 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZNF135P52742 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZNF135P52742 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZNF135P52742 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZNF135P52742 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZNF135P52742 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZNF135P52742 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZNF135P52742 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZNF135P52742 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZNF135P52742 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZNF135P52742 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
ZNF135P52742 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZNF135P52742 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNF135P52742 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNF135P52742 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNF135P52742 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNF135P52742 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNF135P52742 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNF135P52742 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNF135P52742 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNF135P52742 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNF135P52742 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNF135P52742 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNF135P52742 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNF135P52742 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNF135P52742 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNF135P52742 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNF135P52742 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNF135P52742 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNF135P52742 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNF135P52742 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNF135P52742 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNF135P52742 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNF135P52742 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNF135P52742 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNF135P52742 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNF135P52742 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNF135P52742 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNF135P52742 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNF135P52742 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNF135P52742 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNF135P52742 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNF135P52742 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNF135P52742 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNF135P52742 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNF135P52742 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNF135P52742 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNF135P52742 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNF135P52742 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNF135P52742 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNF135P52742 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNF135P52742 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNF135P52742 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNF135P52742 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNF135P52742 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNF135P52742 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNF135P52742 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNF135P52742 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZNF135P52742 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZNF135P52742 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZNF135P52742 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZNF135P52742 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZNF135P52742 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZNF135P52742 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
ZNF135P52742 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZNF135P52742 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms