Protein–RNA interactions for Protein: P48681

NES, Nestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NESP48681 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
NESP48681 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NESP48681 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
NESP48681 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NESP48681 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
NESP48681 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
NESP48681 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NESP48681 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NESP48681 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
NESP48681 LYPLA2-202ENST00000374502 1072 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
NESP48681 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NESP48681 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC27.53■■■□□ 2
NESP48681 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC27.53■■■□□ 2
NESP48681 AC243961.1-201ENST00000432559 384 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
NESP48681 AC245056.1-201ENST00000437631 384 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
NESP48681 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC27.53■■■□□ 2
NESP48681 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC27.53■■■□□ 2
NESP48681 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC27.53■■■□□ 2
NESP48681 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC27.53■■■□□ 2
NESP48681 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
NESP48681 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NESP48681 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NESP48681 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
NESP48681 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NESP48681 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NESP48681 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NESP48681 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC27.53■■■□□ 2
NESP48681 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
NESP48681 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NESP48681 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NESP48681 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
NESP48681 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NESP48681 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NESP48681 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NESP48681 PON3-201ENST00000265627 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NESP48681 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
NESP48681 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NESP48681 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NESP48681 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC27.52■■■□□ 2
NESP48681 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
NESP48681 EIF3K-202ENST00000538434 966 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
NESP48681 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
NESP48681 MIR6756-201ENST00000616240 63 ntBASIC27.52■■■□□ 2
NESP48681 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NESP48681 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NESP48681 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
NESP48681 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NESP48681 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NESP48681 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
NESP48681 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NESP48681 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NESP48681 IGHV3-49-201ENST00000390625 439 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NESP48681 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NESP48681 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
NESP48681 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NESP48681 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NESP48681 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NESP48681 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NESP48681 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NESP48681 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NESP48681 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NESP48681 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NESP48681 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NESP48681 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NESP48681 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NESP48681 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NESP48681 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NESP48681 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NESP48681 AC131097.2-203ENST00000401641 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NESP48681 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NESP48681 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NESP48681 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
NESP48681 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
NESP48681 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NESP48681 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
NESP48681 AC026904.3-201ENST00000636550 1530 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NESP48681 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NESP48681 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NESP48681 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
NESP48681 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NESP48681 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NESP48681 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NESP48681 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NESP48681 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NESP48681 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
NESP48681 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NESP48681 PTK2-225ENST00000520892 571 ntTSL 4 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NESP48681 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NESP48681 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
NESP48681 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
NESP48681 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NESP48681 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NESP48681 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NESP48681 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NESP48681 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NESP48681 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NESP48681 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NESP48681 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NESP48681 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NESP48681 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms