Protein–RNA interactions for Protein: P48668

KRT6C, Keratin, type II cytoskeletal 6C, humanhuman

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT6CP48668 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KRT6CP48668 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KRT6CP48668 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KRT6CP48668 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KRT6CP48668 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KRT6CP48668 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KRT6CP48668 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KRT6CP48668 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
KRT6CP48668 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KRT6CP48668 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KRT6CP48668 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KRT6CP48668 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KRT6CP48668 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KRT6CP48668 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KRT6CP48668 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
KRT6CP48668 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KRT6CP48668 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
KRT6CP48668 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KRT6CP48668 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
KRT6CP48668 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KRT6CP48668 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KRT6CP48668 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KRT6CP48668 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
KRT6CP48668 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KRT6CP48668 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
KRT6CP48668 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KRT6CP48668 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KRT6CP48668 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KRT6CP48668 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KRT6CP48668 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KRT6CP48668 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KRT6CP48668 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KRT6CP48668 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KRT6CP48668 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KRT6CP48668 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KRT6CP48668 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KRT6CP48668 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KRT6CP48668 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KRT6CP48668 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KRT6CP48668 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KRT6CP48668 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KRT6CP48668 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KRT6CP48668 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KRT6CP48668 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KRT6CP48668 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KRT6CP48668 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KRT6CP48668 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KRT6CP48668 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KRT6CP48668 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KRT6CP48668 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KRT6CP48668 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KRT6CP48668 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KRT6CP48668 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KRT6CP48668 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KRT6CP48668 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KRT6CP48668 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KRT6CP48668 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KRT6CP48668 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
KRT6CP48668 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KRT6CP48668 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KRT6CP48668 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
KRT6CP48668 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
KRT6CP48668 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KRT6CP48668 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KRT6CP48668 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KRT6CP48668 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KRT6CP48668 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KRT6CP48668 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KRT6CP48668 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KRT6CP48668 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KRT6CP48668 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
KRT6CP48668 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KRT6CP48668 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KRT6CP48668 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KRT6CP48668 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KRT6CP48668 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KRT6CP48668 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KRT6CP48668 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KRT6CP48668 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KRT6CP48668 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KRT6CP48668 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KRT6CP48668 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KRT6CP48668 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KRT6CP48668 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KRT6CP48668 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KRT6CP48668 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KRT6CP48668 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KRT6CP48668 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KRT6CP48668 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KRT6CP48668 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KRT6CP48668 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KRT6CP48668 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KRT6CP48668 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KRT6CP48668 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KRT6CP48668 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KRT6CP48668 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
KRT6CP48668 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KRT6CP48668 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KRT6CP48668 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KRT6CP48668 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms