Protein–RNA interactions for Protein: P43155

CRAT, Carnitine O-acetyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRATP43155 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CRATP43155 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CRATP43155 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CRATP43155 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CRATP43155 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CRATP43155 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CRATP43155 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CRATP43155 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CRATP43155 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CRATP43155 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CRATP43155 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CRATP43155 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CRATP43155 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CRATP43155 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CRATP43155 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CRATP43155 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CRATP43155 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CRATP43155 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CRATP43155 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CRATP43155 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CRATP43155 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CRATP43155 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CRATP43155 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CRATP43155 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CRATP43155 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CRATP43155 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CRATP43155 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CRATP43155 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CRATP43155 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CRATP43155 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CRATP43155 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CRATP43155 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CRATP43155 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CRATP43155 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CRATP43155 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CRATP43155 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CRATP43155 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CRATP43155 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CRATP43155 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CRATP43155 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CRATP43155 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CRATP43155 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CRATP43155 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CRATP43155 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CRATP43155 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CRATP43155 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CRATP43155 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CRATP43155 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CRATP43155 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CRATP43155 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CRATP43155 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CRATP43155 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CRATP43155 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CRATP43155 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CRATP43155 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CRATP43155 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CRATP43155 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CRATP43155 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CRATP43155 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CRATP43155 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CRATP43155 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CRATP43155 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CRATP43155 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CRATP43155 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CRATP43155 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CRATP43155 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CRATP43155 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CRATP43155 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CRATP43155 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CRATP43155 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CRATP43155 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CRATP43155 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CRATP43155 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CRATP43155 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CRATP43155 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CRATP43155 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CRATP43155 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CRATP43155 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CRATP43155 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CRATP43155 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CRATP43155 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CRATP43155 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CRATP43155 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CRATP43155 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CRATP43155 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CRATP43155 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CRATP43155 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CRATP43155 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CRATP43155 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CRATP43155 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CRATP43155 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CRATP43155 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CRATP43155 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CRATP43155 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CRATP43155 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CRATP43155 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CRATP43155 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CRATP43155 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CRATP43155 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CRATP43155 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms