Protein–RNA interactions for Protein: P43026

GDF5, Growth/differentiation factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF5P43026 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
GDF5P43026 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GDF5P43026 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GDF5P43026 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GDF5P43026 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GDF5P43026 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
GDF5P43026 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
GDF5P43026 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GDF5P43026 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GDF5P43026 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
GDF5P43026 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GDF5P43026 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GDF5P43026 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GDF5P43026 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GDF5P43026 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GDF5P43026 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GDF5P43026 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GDF5P43026 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GDF5P43026 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GDF5P43026 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GDF5P43026 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GDF5P43026 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GDF5P43026 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GDF5P43026 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GDF5P43026 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GDF5P43026 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GDF5P43026 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GDF5P43026 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GDF5P43026 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GDF5P43026 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
GDF5P43026 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
GDF5P43026 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
GDF5P43026 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
GDF5P43026 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
GDF5P43026 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
GDF5P43026 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
GDF5P43026 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.14
GDF5P43026 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
GDF5P43026 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GDF5P43026 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GDF5P43026 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GDF5P43026 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GDF5P43026 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GDF5P43026 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GDF5P43026 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GDF5P43026 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GDF5P43026 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GDF5P43026 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GDF5P43026 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GDF5P43026 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GDF5P43026 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
GDF5P43026 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GDF5P43026 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GDF5P43026 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GDF5P43026 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GDF5P43026 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GDF5P43026 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GDF5P43026 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GDF5P43026 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GDF5P43026 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GDF5P43026 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
GDF5P43026 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GDF5P43026 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GDF5P43026 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GDF5P43026 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
GDF5P43026 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GDF5P43026 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GDF5P43026 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GDF5P43026 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GDF5P43026 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GDF5P43026 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GDF5P43026 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GDF5P43026 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GDF5P43026 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GDF5P43026 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GDF5P43026 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GDF5P43026 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GDF5P43026 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GDF5P43026 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GDF5P43026 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GDF5P43026 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GDF5P43026 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GDF5P43026 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GDF5P43026 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GDF5P43026 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GDF5P43026 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GDF5P43026 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GDF5P43026 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GDF5P43026 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GDF5P43026 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GDF5P43026 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GDF5P43026 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GDF5P43026 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
GDF5P43026 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GDF5P43026 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GDF5P43026 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GDF5P43026 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GDF5P43026 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GDF5P43026 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GDF5P43026 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms