Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXD12P35452 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXD12P35452 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXD12P35452 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXD12P35452 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXD12P35452 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXD12P35452 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXD12P35452 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXD12P35452 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXD12P35452 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXD12P35452 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXD12P35452 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXD12P35452 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXD12P35452 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXD12P35452 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXD12P35452 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXD12P35452 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXD12P35452 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXD12P35452 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXD12P35452 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXD12P35452 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXD12P35452 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXD12P35452 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXD12P35452 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXD12P35452 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXD12P35452 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXD12P35452 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXD12P35452 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXD12P35452 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXD12P35452 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXD12P35452 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXD12P35452 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXD12P35452 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXD12P35452 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXD12P35452 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXD12P35452 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXD12P35452 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXD12P35452 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXD12P35452 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXD12P35452 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXD12P35452 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXD12P35452 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXD12P35452 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXD12P35452 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXD12P35452 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXD12P35452 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXD12P35452 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXD12P35452 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXD12P35452 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXD12P35452 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXD12P35452 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXD12P35452 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXD12P35452 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXD12P35452 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXD12P35452 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXD12P35452 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXD12P35452 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXD12P35452 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXD12P35452 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXD12P35452 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXD12P35452 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXD12P35452 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXD12P35452 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXD12P35452 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXD12P35452 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXD12P35452 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXD12P35452 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXD12P35452 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXD12P35452 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXD12P35452 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXD12P35452 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXD12P35452 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXD12P35452 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXD12P35452 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXD12P35452 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXD12P35452 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXD12P35452 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXD12P35452 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXD12P35452 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXD12P35452 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXD12P35452 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXD12P35452 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXD12P35452 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXD12P35452 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXD12P35452 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXD12P35452 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXD12P35452 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXD12P35452 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXD12P35452 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXD12P35452 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXD12P35452 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXD12P35452 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXD12P35452 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXD12P35452 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXD12P35452 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXD12P35452 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXD12P35452 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXD12P35452 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXD12P35452 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXD12P35452 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms