Protein–RNA interactions for Protein: P30405

PPIF, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase F, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPIFP30405 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
PPIFP30405 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PPIFP30405 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PPIFP30405 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PPIFP30405 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PPIFP30405 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PPIFP30405 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PPIFP30405 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
PPIFP30405 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PPIFP30405 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
PPIFP30405 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
PPIFP30405 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
PPIFP30405 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
PPIFP30405 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
PPIFP30405 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
PPIFP30405 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
PPIFP30405 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PPIFP30405 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PPIFP30405 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
PPIFP30405 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PPIFP30405 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
PPIFP30405 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC13□□□□□ -0.33
PPIFP30405 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
PPIFP30405 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PPIFP30405 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC13□□□□□ -0.33
PPIFP30405 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC13□□□□□ -0.33
PPIFP30405 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
PPIFP30405 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
PPIFP30405 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
PPIFP30405 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
PPIFP30405 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
PPIFP30405 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
PPIFP30405 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PPIFP30405 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
PPIFP30405 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
PPIFP30405 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
PPIFP30405 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC13□□□□□ -0.33
PPIFP30405 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PPIFP30405 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
PPIFP30405 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
PPIFP30405 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
PPIFP30405 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PPIFP30405 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PPIFP30405 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PPIFP30405 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PPIFP30405 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
PPIFP30405 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PPIFP30405 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PPIFP30405 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PPIFP30405 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PPIFP30405 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PPIFP30405 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
PPIFP30405 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
PPIFP30405 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
PPIFP30405 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PPIFP30405 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
PPIFP30405 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PPIFP30405 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PPIFP30405 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
PPIFP30405 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PPIFP30405 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PPIFP30405 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PPIFP30405 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PPIFP30405 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PPIFP30405 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
PPIFP30405 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PPIFP30405 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PPIFP30405 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PPIFP30405 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PPIFP30405 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PPIFP30405 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PPIFP30405 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PPIFP30405 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PPIFP30405 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PPIFP30405 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PPIFP30405 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PPIFP30405 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PPIFP30405 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PPIFP30405 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PPIFP30405 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PPIFP30405 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PPIFP30405 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PPIFP30405 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PPIFP30405 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PPIFP30405 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
PPIFP30405 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PPIFP30405 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
PPIFP30405 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PPIFP30405 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PPIFP30405 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PPIFP30405 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
PPIFP30405 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
PPIFP30405 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PPIFP30405 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PPIFP30405 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PPIFP30405 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PPIFP30405 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PPIFP30405 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PPIFP30405 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PPIFP30405 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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