Protein–RNA interactions for Protein: P29466

CASP1, Caspase-1, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP1P29466 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CASP1P29466 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CASP1P29466 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CASP1P29466 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CASP1P29466 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CASP1P29466 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CASP1P29466 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CASP1P29466 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CASP1P29466 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CASP1P29466 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CASP1P29466 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CASP1P29466 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CASP1P29466 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CASP1P29466 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CASP1P29466 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CASP1P29466 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CASP1P29466 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CASP1P29466 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CASP1P29466 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CASP1P29466 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CASP1P29466 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CASP1P29466 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CASP1P29466 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CASP1P29466 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CASP1P29466 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CASP1P29466 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CASP1P29466 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CASP1P29466 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CASP1P29466 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CASP1P29466 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CASP1P29466 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CASP1P29466 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CASP1P29466 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CASP1P29466 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CASP1P29466 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CASP1P29466 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CASP1P29466 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CASP1P29466 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CASP1P29466 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CASP1P29466 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CASP1P29466 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CASP1P29466 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CASP1P29466 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CASP1P29466 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CASP1P29466 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CASP1P29466 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CASP1P29466 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CASP1P29466 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CASP1P29466 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CASP1P29466 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CASP1P29466 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CASP1P29466 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CASP1P29466 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CASP1P29466 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CASP1P29466 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CASP1P29466 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CASP1P29466 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CASP1P29466 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CASP1P29466 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CASP1P29466 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CASP1P29466 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CASP1P29466 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CASP1P29466 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CASP1P29466 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CASP1P29466 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CASP1P29466 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CASP1P29466 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CASP1P29466 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CASP1P29466 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CASP1P29466 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CASP1P29466 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CASP1P29466 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CASP1P29466 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CASP1P29466 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CASP1P29466 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CASP1P29466 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CASP1P29466 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CASP1P29466 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CASP1P29466 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CASP1P29466 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CASP1P29466 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CASP1P29466 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CASP1P29466 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CASP1P29466 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CASP1P29466 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CASP1P29466 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CASP1P29466 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CASP1P29466 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CASP1P29466 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CASP1P29466 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CASP1P29466 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CASP1P29466 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CASP1P29466 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CASP1P29466 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CASP1P29466 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CASP1P29466 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CASP1P29466 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CASP1P29466 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CASP1P29466 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CASP1P29466 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms