Protein–RNA interactions for Protein: P29353

SHC1, SHC-transforming protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHC1P29353 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SHC1P29353 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SHC1P29353 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
SHC1P29353 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SHC1P29353 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SHC1P29353 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SHC1P29353 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SHC1P29353 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
SHC1P29353 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SHC1P29353 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SHC1P29353 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
SHC1P29353 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SHC1P29353 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SHC1P29353 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SHC1P29353 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SHC1P29353 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SHC1P29353 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SHC1P29353 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SHC1P29353 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SHC1P29353 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SHC1P29353 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SHC1P29353 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SHC1P29353 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SHC1P29353 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
SHC1P29353 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SHC1P29353 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SHC1P29353 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SHC1P29353 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SHC1P29353 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SHC1P29353 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SHC1P29353 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SHC1P29353 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SHC1P29353 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SHC1P29353 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SHC1P29353 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SHC1P29353 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SHC1P29353 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SHC1P29353 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SHC1P29353 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SHC1P29353 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SHC1P29353 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SHC1P29353 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SHC1P29353 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SHC1P29353 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SHC1P29353 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SHC1P29353 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SHC1P29353 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SHC1P29353 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SHC1P29353 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SHC1P29353 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SHC1P29353 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SHC1P29353 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SHC1P29353 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SHC1P29353 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SHC1P29353 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SHC1P29353 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SHC1P29353 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SHC1P29353 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SHC1P29353 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
SHC1P29353 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SHC1P29353 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SHC1P29353 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SHC1P29353 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SHC1P29353 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SHC1P29353 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SHC1P29353 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SHC1P29353 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
SHC1P29353 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SHC1P29353 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SHC1P29353 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SHC1P29353 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SHC1P29353 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SHC1P29353 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SHC1P29353 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SHC1P29353 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SHC1P29353 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SHC1P29353 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SHC1P29353 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SHC1P29353 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SHC1P29353 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SHC1P29353 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SHC1P29353 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SHC1P29353 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SHC1P29353 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SHC1P29353 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SHC1P29353 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SHC1P29353 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.03■□□□□ -0
SHC1P29353 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SHC1P29353 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SHC1P29353 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SHC1P29353 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SHC1P29353 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SHC1P29353 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SHC1P29353 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SHC1P29353 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SHC1P29353 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SHC1P29353 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SHC1P29353 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SHC1P29353 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SHC1P29353 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms