Protein–RNA interactions for Protein: P29083

GTF2E1, General transcription factor IIE subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E1P29083 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
GTF2E1P29083 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GTF2E1P29083 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
GTF2E1P29083 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GTF2E1P29083 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
GTF2E1P29083 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
GTF2E1P29083 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
GTF2E1P29083 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GTF2E1P29083 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
GTF2E1P29083 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GTF2E1P29083 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GTF2E1P29083 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GTF2E1P29083 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GTF2E1P29083 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GTF2E1P29083 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GTF2E1P29083 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GTF2E1P29083 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GTF2E1P29083 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GTF2E1P29083 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GTF2E1P29083 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GTF2E1P29083 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GTF2E1P29083 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GTF2E1P29083 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GTF2E1P29083 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GTF2E1P29083 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GTF2E1P29083 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GTF2E1P29083 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
GTF2E1P29083 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GTF2E1P29083 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GTF2E1P29083 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GTF2E1P29083 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GTF2E1P29083 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GTF2E1P29083 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GTF2E1P29083 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GTF2E1P29083 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GTF2E1P29083 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GTF2E1P29083 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GTF2E1P29083 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GTF2E1P29083 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GTF2E1P29083 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
GTF2E1P29083 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GTF2E1P29083 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GTF2E1P29083 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GTF2E1P29083 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GTF2E1P29083 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GTF2E1P29083 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GTF2E1P29083 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GTF2E1P29083 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GTF2E1P29083 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GTF2E1P29083 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GTF2E1P29083 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GTF2E1P29083 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GTF2E1P29083 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GTF2E1P29083 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GTF2E1P29083 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GTF2E1P29083 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GTF2E1P29083 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GTF2E1P29083 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GTF2E1P29083 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GTF2E1P29083 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GTF2E1P29083 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GTF2E1P29083 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GTF2E1P29083 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GTF2E1P29083 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GTF2E1P29083 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GTF2E1P29083 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GTF2E1P29083 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GTF2E1P29083 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GTF2E1P29083 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GTF2E1P29083 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GTF2E1P29083 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GTF2E1P29083 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GTF2E1P29083 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GTF2E1P29083 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GTF2E1P29083 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GTF2E1P29083 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GTF2E1P29083 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GTF2E1P29083 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GTF2E1P29083 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GTF2E1P29083 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GTF2E1P29083 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GTF2E1P29083 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GTF2E1P29083 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GTF2E1P29083 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GTF2E1P29083 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GTF2E1P29083 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
GTF2E1P29083 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GTF2E1P29083 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GTF2E1P29083 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GTF2E1P29083 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GTF2E1P29083 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GTF2E1P29083 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GTF2E1P29083 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GTF2E1P29083 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GTF2E1P29083 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GTF2E1P29083 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GTF2E1P29083 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GTF2E1P29083 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GTF2E1P29083 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GTF2E1P29083 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms