Protein–RNA interactions for Protein: P28065

PSMB9, Proteasome subunit beta type-9, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB9P28065 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PSMB9P28065 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PSMB9P28065 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
PSMB9P28065 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PSMB9P28065 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PSMB9P28065 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PSMB9P28065 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PSMB9P28065 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PSMB9P28065 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PSMB9P28065 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PSMB9P28065 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PSMB9P28065 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PSMB9P28065 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PSMB9P28065 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PSMB9P28065 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PSMB9P28065 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PSMB9P28065 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PSMB9P28065 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PSMB9P28065 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PSMB9P28065 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PSMB9P28065 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PSMB9P28065 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PSMB9P28065 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PSMB9P28065 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PSMB9P28065 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PSMB9P28065 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PSMB9P28065 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PSMB9P28065 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PSMB9P28065 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PSMB9P28065 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PSMB9P28065 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
PSMB9P28065 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PSMB9P28065 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PSMB9P28065 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PSMB9P28065 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PSMB9P28065 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PSMB9P28065 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PSMB9P28065 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PSMB9P28065 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PSMB9P28065 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PSMB9P28065 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PSMB9P28065 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PSMB9P28065 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PSMB9P28065 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PSMB9P28065 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PSMB9P28065 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PSMB9P28065 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PSMB9P28065 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
PSMB9P28065 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PSMB9P28065 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PSMB9P28065 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PSMB9P28065 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PSMB9P28065 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
PSMB9P28065 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PSMB9P28065 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PSMB9P28065 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PSMB9P28065 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PSMB9P28065 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PSMB9P28065 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PSMB9P28065 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PSMB9P28065 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PSMB9P28065 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PSMB9P28065 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PSMB9P28065 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PSMB9P28065 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
PSMB9P28065 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
PSMB9P28065 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PSMB9P28065 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PSMB9P28065 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PSMB9P28065 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PSMB9P28065 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
PSMB9P28065 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PSMB9P28065 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
PSMB9P28065 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PSMB9P28065 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PSMB9P28065 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PSMB9P28065 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PSMB9P28065 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PSMB9P28065 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PSMB9P28065 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PSMB9P28065 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PSMB9P28065 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PSMB9P28065 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PSMB9P28065 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PSMB9P28065 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PSMB9P28065 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PSMB9P28065 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PSMB9P28065 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PSMB9P28065 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PSMB9P28065 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PSMB9P28065 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PSMB9P28065 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PSMB9P28065 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PSMB9P28065 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PSMB9P28065 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PSMB9P28065 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PSMB9P28065 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PSMB9P28065 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PSMB9P28065 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PSMB9P28065 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms