Protein–RNA interactions for Protein: P23763

VAMP1, Vesicle-associated membrane protein 1, humanhuman

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Length 118 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP1P23763 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
VAMP1P23763 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC13.9□□□□□ -0.18
VAMP1P23763 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
VAMP1P23763 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
VAMP1P23763 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
VAMP1P23763 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
VAMP1P23763 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
VAMP1P23763 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
VAMP1P23763 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
VAMP1P23763 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
VAMP1P23763 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
VAMP1P23763 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
VAMP1P23763 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
VAMP1P23763 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
VAMP1P23763 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
VAMP1P23763 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
VAMP1P23763 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
VAMP1P23763 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
VAMP1P23763 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.19
VAMP1P23763 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
VAMP1P23763 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
VAMP1P23763 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
VAMP1P23763 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
VAMP1P23763 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
VAMP1P23763 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
VAMP1P23763 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
VAMP1P23763 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
VAMP1P23763 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
VAMP1P23763 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
VAMP1P23763 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
VAMP1P23763 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
VAMP1P23763 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
VAMP1P23763 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
VAMP1P23763 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
VAMP1P23763 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
VAMP1P23763 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
VAMP1P23763 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
VAMP1P23763 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
VAMP1P23763 ACKR3-201ENST00000272928 2203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
VAMP1P23763 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
VAMP1P23763 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
VAMP1P23763 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
VAMP1P23763 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
VAMP1P23763 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
VAMP1P23763 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
VAMP1P23763 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
VAMP1P23763 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
VAMP1P23763 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
VAMP1P23763 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
VAMP1P23763 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
VAMP1P23763 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
VAMP1P23763 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
VAMP1P23763 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
VAMP1P23763 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
VAMP1P23763 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
VAMP1P23763 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
VAMP1P23763 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
VAMP1P23763 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
VAMP1P23763 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC13.89□□□□□ -0.19
VAMP1P23763 CRYBG1-204ENST00000633556 9909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
VAMP1P23763 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
VAMP1P23763 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
VAMP1P23763 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
VAMP1P23763 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
VAMP1P23763 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
VAMP1P23763 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
VAMP1P23763 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC13.89□□□□□ -0.19
VAMP1P23763 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
VAMP1P23763 NFIC-206ENST00000589123 8068 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
VAMP1P23763 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
VAMP1P23763 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
VAMP1P23763 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
VAMP1P23763 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
VAMP1P23763 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
VAMP1P23763 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
VAMP1P23763 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
VAMP1P23763 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
VAMP1P23763 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
VAMP1P23763 BCL9L-201ENST00000334801 10005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
VAMP1P23763 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
VAMP1P23763 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
VAMP1P23763 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
VAMP1P23763 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
VAMP1P23763 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
VAMP1P23763 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
VAMP1P23763 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
VAMP1P23763 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
VAMP1P23763 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
VAMP1P23763 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
VAMP1P23763 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
VAMP1P23763 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
VAMP1P23763 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
VAMP1P23763 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
VAMP1P23763 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
VAMP1P23763 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
VAMP1P23763 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
VAMP1P23763 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
VAMP1P23763 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
VAMP1P23763 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
VAMP1P23763 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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