Protein–RNA interactions for Protein: P23409

MYF6, Myogenic factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYF6P23409 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
MYF6P23409 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
MYF6P23409 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC15.07■□□□□ 0
MYF6P23409 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
MYF6P23409 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC15.07■□□□□ 0
MYF6P23409 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC15.07■□□□□ 0
MYF6P23409 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MYF6P23409 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
MYF6P23409 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC15.07■□□□□ 0
MYF6P23409 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC15.07■□□□□ 0
MYF6P23409 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MYF6P23409 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MYF6P23409 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
MYF6P23409 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MYF6P23409 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MYF6P23409 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MYF6P23409 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MYF6P23409 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MYF6P23409 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MYF6P23409 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MYF6P23409 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MYF6P23409 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
MYF6P23409 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MYF6P23409 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MYF6P23409 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC15.07■□□□□ 0
MYF6P23409 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MYF6P23409 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MYF6P23409 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MYF6P23409 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MYF6P23409 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
MYF6P23409 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
MYF6P23409 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MYF6P23409 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
MYF6P23409 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MYF6P23409 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
MYF6P23409 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
MYF6P23409 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MYF6P23409 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
MYF6P23409 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
MYF6P23409 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
MYF6P23409 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MYF6P23409 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC15.06■□□□□ 0
MYF6P23409 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC15.06■□□□□ 0
MYF6P23409 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MYF6P23409 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MYF6P23409 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MYF6P23409 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
MYF6P23409 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MYF6P23409 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
MYF6P23409 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MYF6P23409 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
MYF6P23409 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC15.06■□□□□ 0
MYF6P23409 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
MYF6P23409 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
MYF6P23409 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MYF6P23409 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
MYF6P23409 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MYF6P23409 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MYF6P23409 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MYF6P23409 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MYF6P23409 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
MYF6P23409 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MYF6P23409 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MYF6P23409 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
MYF6P23409 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
MYF6P23409 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MYF6P23409 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
MYF6P23409 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
MYF6P23409 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
MYF6P23409 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
MYF6P23409 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
MYF6P23409 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
MYF6P23409 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
MYF6P23409 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
MYF6P23409 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
MYF6P23409 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
MYF6P23409 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
MYF6P23409 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MYF6P23409 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
MYF6P23409 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MYF6P23409 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MYF6P23409 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MYF6P23409 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
MYF6P23409 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC15.05■□□□□ -0
MYF6P23409 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC15.05■□□□□ -0
MYF6P23409 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
MYF6P23409 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
MYF6P23409 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
MYF6P23409 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
MYF6P23409 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
MYF6P23409 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
MYF6P23409 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MYF6P23409 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
MYF6P23409 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MYF6P23409 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
MYF6P23409 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MYF6P23409 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
MYF6P23409 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MYF6P23409 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MYF6P23409 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms