Protein–RNA interactions for Protein: P19474

TRIM21, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM21, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM21P19474 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM21P19474 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM21P19474 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM21P19474 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM21P19474 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM21P19474 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM21P19474 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM21P19474 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM21P19474 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM21P19474 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM21P19474 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM21P19474 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM21P19474 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM21P19474 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM21P19474 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM21P19474 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM21P19474 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM21P19474 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM21P19474 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM21P19474 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM21P19474 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM21P19474 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM21P19474 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM21P19474 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM21P19474 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM21P19474 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM21P19474 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM21P19474 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM21P19474 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM21P19474 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM21P19474 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM21P19474 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM21P19474 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM21P19474 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM21P19474 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM21P19474 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM21P19474 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM21P19474 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM21P19474 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM21P19474 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM21P19474 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM21P19474 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM21P19474 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM21P19474 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM21P19474 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM21P19474 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM21P19474 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM21P19474 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIM21P19474 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIM21P19474 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIM21P19474 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIM21P19474 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIM21P19474 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIM21P19474 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIM21P19474 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIM21P19474 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIM21P19474 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIM21P19474 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIM21P19474 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIM21P19474 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIM21P19474 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIM21P19474 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIM21P19474 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIM21P19474 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIM21P19474 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIM21P19474 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIM21P19474 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIM21P19474 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIM21P19474 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIM21P19474 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIM21P19474 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIM21P19474 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIM21P19474 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIM21P19474 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIM21P19474 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIM21P19474 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIM21P19474 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIM21P19474 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIM21P19474 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIM21P19474 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIM21P19474 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIM21P19474 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIM21P19474 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIM21P19474 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIM21P19474 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIM21P19474 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRIM21P19474 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRIM21P19474 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRIM21P19474 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRIM21P19474 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRIM21P19474 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRIM21P19474 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRIM21P19474 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRIM21P19474 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRIM21P19474 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRIM21P19474 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
TRIM21P19474 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRIM21P19474 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRIM21P19474 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRIM21P19474 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms