Protein–RNA interactions for Protein: P18847

ATF3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF3P18847 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATF3P18847 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATF3P18847 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATF3P18847 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATF3P18847 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATF3P18847 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATF3P18847 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATF3P18847 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATF3P18847 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATF3P18847 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATF3P18847 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATF3P18847 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATF3P18847 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATF3P18847 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATF3P18847 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATF3P18847 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATF3P18847 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ATF3P18847 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ATF3P18847 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATF3P18847 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ATF3P18847 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATF3P18847 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATF3P18847 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ATF3P18847 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ATF3P18847 MPRIPP1-201ENST00000452433 1089 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ATF3P18847 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATF3P18847 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATF3P18847 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATF3P18847 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATF3P18847 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATF3P18847 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATF3P18847 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATF3P18847 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATF3P18847 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATF3P18847 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATF3P18847 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATF3P18847 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATF3P18847 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATF3P18847 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATF3P18847 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATF3P18847 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATF3P18847 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ATF3P18847 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATF3P18847 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATF3P18847 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATF3P18847 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATF3P18847 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ATF3P18847 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATF3P18847 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ATF3P18847 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATF3P18847 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATF3P18847 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ATF3P18847 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATF3P18847 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATF3P18847 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATF3P18847 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATF3P18847 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATF3P18847 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATF3P18847 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATF3P18847 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATF3P18847 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATF3P18847 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATF3P18847 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATF3P18847 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATF3P18847 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATF3P18847 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATF3P18847 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATF3P18847 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATF3P18847 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATF3P18847 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ATF3P18847 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ATF3P18847 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
ATF3P18847 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ATF3P18847 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ATF3P18847 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ATF3P18847 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATF3P18847 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATF3P18847 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATF3P18847 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATF3P18847 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATF3P18847 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATF3P18847 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATF3P18847 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATF3P18847 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATF3P18847 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ATF3P18847 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATF3P18847 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ATF3P18847 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ATF3P18847 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATF3P18847 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATF3P18847 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATF3P18847 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATF3P18847 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATF3P18847 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATF3P18847 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATF3P18847 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATF3P18847 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATF3P18847 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATF3P18847 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATF3P18847 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms