Protein–RNA interactions for Protein: P17947

SPI1, Transcription factor PU.1, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPI1P17947 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SPI1P17947 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SPI1P17947 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SPI1P17947 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SPI1P17947 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SPI1P17947 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SPI1P17947 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SPI1P17947 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SPI1P17947 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
SPI1P17947 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SPI1P17947 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SPI1P17947 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
SPI1P17947 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
SPI1P17947 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SPI1P17947 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
SPI1P17947 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SPI1P17947 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SPI1P17947 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SPI1P17947 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
SPI1P17947 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SPI1P17947 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SPI1P17947 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SPI1P17947 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SPI1P17947 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SPI1P17947 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SPI1P17947 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SPI1P17947 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SPI1P17947 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SPI1P17947 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SPI1P17947 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SPI1P17947 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SPI1P17947 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SPI1P17947 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SPI1P17947 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SPI1P17947 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SPI1P17947 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SPI1P17947 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SPI1P17947 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SPI1P17947 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SPI1P17947 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SPI1P17947 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SPI1P17947 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SPI1P17947 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SPI1P17947 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SPI1P17947 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SPI1P17947 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SPI1P17947 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SPI1P17947 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SPI1P17947 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
SPI1P17947 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SPI1P17947 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SPI1P17947 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SPI1P17947 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
SPI1P17947 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
SPI1P17947 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
SPI1P17947 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
SPI1P17947 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SPI1P17947 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
SPI1P17947 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
SPI1P17947 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SPI1P17947 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SPI1P17947 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SPI1P17947 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SPI1P17947 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SPI1P17947 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SPI1P17947 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SPI1P17947 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SPI1P17947 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SPI1P17947 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SPI1P17947 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
SPI1P17947 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SPI1P17947 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SPI1P17947 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SPI1P17947 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SPI1P17947 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SPI1P17947 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SPI1P17947 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SPI1P17947 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SPI1P17947 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SPI1P17947 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SPI1P17947 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SPI1P17947 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SPI1P17947 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SPI1P17947 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SPI1P17947 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SPI1P17947 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SPI1P17947 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SPI1P17947 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SPI1P17947 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SPI1P17947 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SPI1P17947 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SPI1P17947 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SPI1P17947 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SPI1P17947 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SPI1P17947 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SPI1P17947 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SPI1P17947 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SPI1P17947 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SPI1P17947 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SPI1P17947 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms