Protein–RNA interactions for Protein: P17482

HOXB9, Homeobox protein Hox-B9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB9P17482 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXB9P17482 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXB9P17482 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXB9P17482 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXB9P17482 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXB9P17482 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXB9P17482 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXB9P17482 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXB9P17482 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXB9P17482 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXB9P17482 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXB9P17482 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXB9P17482 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXB9P17482 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXB9P17482 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXB9P17482 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXB9P17482 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXB9P17482 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXB9P17482 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXB9P17482 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXB9P17482 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXB9P17482 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXB9P17482 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXB9P17482 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXB9P17482 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXB9P17482 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXB9P17482 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXB9P17482 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXB9P17482 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXB9P17482 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXB9P17482 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXB9P17482 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXB9P17482 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXB9P17482 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXB9P17482 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXB9P17482 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXB9P17482 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXB9P17482 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXB9P17482 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXB9P17482 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXB9P17482 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXB9P17482 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXB9P17482 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXB9P17482 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXB9P17482 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXB9P17482 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXB9P17482 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXB9P17482 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXB9P17482 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXB9P17482 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXB9P17482 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXB9P17482 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXB9P17482 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXB9P17482 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXB9P17482 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXB9P17482 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXB9P17482 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXB9P17482 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXB9P17482 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXB9P17482 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXB9P17482 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXB9P17482 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXB9P17482 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXB9P17482 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXB9P17482 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXB9P17482 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXB9P17482 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXB9P17482 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXB9P17482 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXB9P17482 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXB9P17482 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXB9P17482 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXB9P17482 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXB9P17482 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXB9P17482 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXB9P17482 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXB9P17482 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXB9P17482 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXB9P17482 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXB9P17482 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXB9P17482 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXB9P17482 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXB9P17482 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXB9P17482 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXB9P17482 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXB9P17482 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXB9P17482 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXB9P17482 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXB9P17482 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXB9P17482 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXB9P17482 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXB9P17482 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXB9P17482 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXB9P17482 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXB9P17482 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXB9P17482 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXB9P17482 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXB9P17482 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXB9P17482 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXB9P17482 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms