Protein–RNA interactions for Protein: P16619

CCL3L1, C-C motif chemokine 3-like 1, humanhuman

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL3L1P16619 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CCL3L1P16619 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CCL3L1P16619 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
CCL3L1P16619 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CCL3L1P16619 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CCL3L1P16619 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CCL3L1P16619 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CCL3L1P16619 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
CCL3L1P16619 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
CCL3L1P16619 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CCL3L1P16619 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CCL3L1P16619 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CCL3L1P16619 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CCL3L1P16619 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CCL3L1P16619 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CCL3L1P16619 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CCL3L1P16619 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CCL3L1P16619 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CCL3L1P16619 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CCL3L1P16619 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CCL3L1P16619 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CCL3L1P16619 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CCL3L1P16619 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CCL3L1P16619 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CCL3L1P16619 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CCL3L1P16619 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
CCL3L1P16619 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CCL3L1P16619 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CCL3L1P16619 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CCL3L1P16619 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CCL3L1P16619 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CCL3L1P16619 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
CCL3L1P16619 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
CCL3L1P16619 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CCL3L1P16619 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CCL3L1P16619 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
CCL3L1P16619 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CCL3L1P16619 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CCL3L1P16619 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CCL3L1P16619 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
CCL3L1P16619 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CCL3L1P16619 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CCL3L1P16619 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
CCL3L1P16619 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CCL3L1P16619 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CCL3L1P16619 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CCL3L1P16619 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CCL3L1P16619 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CCL3L1P16619 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
CCL3L1P16619 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
CCL3L1P16619 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CCL3L1P16619 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CCL3L1P16619 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CCL3L1P16619 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CCL3L1P16619 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CCL3L1P16619 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CCL3L1P16619 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CCL3L1P16619 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CCL3L1P16619 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CCL3L1P16619 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CCL3L1P16619 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CCL3L1P16619 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CCL3L1P16619 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CCL3L1P16619 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CCL3L1P16619 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CCL3L1P16619 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CCL3L1P16619 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CCL3L1P16619 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CCL3L1P16619 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CCL3L1P16619 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CCL3L1P16619 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CCL3L1P16619 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CCL3L1P16619 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CCL3L1P16619 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CCL3L1P16619 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CCL3L1P16619 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CCL3L1P16619 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CCL3L1P16619 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CCL3L1P16619 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CCL3L1P16619 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CCL3L1P16619 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CCL3L1P16619 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CCL3L1P16619 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CCL3L1P16619 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CCL3L1P16619 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CCL3L1P16619 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CCL3L1P16619 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CCL3L1P16619 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CCL3L1P16619 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
CCL3L1P16619 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CCL3L1P16619 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CCL3L1P16619 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CCL3L1P16619 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CCL3L1P16619 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CCL3L1P16619 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CCL3L1P16619 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CCL3L1P16619 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CCL3L1P16619 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CCL3L1P16619 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
CCL3L1P16619 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
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