Protein–RNA interactions for Protein: P11686

SFTPC, Pulmonary surfactant-associated protein C, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPCP11686 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SFTPCP11686 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SFTPCP11686 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SFTPCP11686 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
SFTPCP11686 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SFTPCP11686 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SFTPCP11686 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SFTPCP11686 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SFTPCP11686 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
SFTPCP11686 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SFTPCP11686 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SFTPCP11686 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SFTPCP11686 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SFTPCP11686 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SFTPCP11686 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SFTPCP11686 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SFTPCP11686 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SFTPCP11686 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SFTPCP11686 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SFTPCP11686 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SFTPCP11686 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
SFTPCP11686 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
SFTPCP11686 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
SFTPCP11686 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
SFTPCP11686 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
SFTPCP11686 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
SFTPCP11686 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
SFTPCP11686 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
SFTPCP11686 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
SFTPCP11686 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
SFTPCP11686 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
SFTPCP11686 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
SFTPCP11686 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
SFTPCP11686 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
SFTPCP11686 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SFTPCP11686 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SFTPCP11686 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SFTPCP11686 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SFTPCP11686 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SFTPCP11686 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SFTPCP11686 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SFTPCP11686 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SFTPCP11686 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SFTPCP11686 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SFTPCP11686 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SFTPCP11686 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
SFTPCP11686 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
SFTPCP11686 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
SFTPCP11686 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SFTPCP11686 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SFTPCP11686 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SFTPCP11686 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SFTPCP11686 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
SFTPCP11686 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SFTPCP11686 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
SFTPCP11686 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SFTPCP11686 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
SFTPCP11686 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
SFTPCP11686 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SFTPCP11686 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SFTPCP11686 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SFTPCP11686 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SFTPCP11686 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SFTPCP11686 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SFTPCP11686 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SFTPCP11686 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SFTPCP11686 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SFTPCP11686 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SFTPCP11686 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SFTPCP11686 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SFTPCP11686 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SFTPCP11686 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SFTPCP11686 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
SFTPCP11686 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SFTPCP11686 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SFTPCP11686 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SFTPCP11686 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SFTPCP11686 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SFTPCP11686 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SFTPCP11686 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SFTPCP11686 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SFTPCP11686 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SFTPCP11686 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SFTPCP11686 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SFTPCP11686 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
SFTPCP11686 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SFTPCP11686 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
SFTPCP11686 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
SFTPCP11686 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SFTPCP11686 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SFTPCP11686 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
SFTPCP11686 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SFTPCP11686 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SFTPCP11686 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SFTPCP11686 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SFTPCP11686 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SFTPCP11686 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SFTPCP11686 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
SFTPCP11686 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
SFTPCP11686 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms