Protein–RNA interactions for Protein: P10826

RARB, Retinoic acid receptor beta, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARBP10826 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RARBP10826 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RARBP10826 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RARBP10826 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RARBP10826 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RARBP10826 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RARBP10826 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RARBP10826 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RARBP10826 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RARBP10826 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RARBP10826 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RARBP10826 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RARBP10826 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RARBP10826 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RARBP10826 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RARBP10826 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RARBP10826 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RARBP10826 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RARBP10826 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RARBP10826 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RARBP10826 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RARBP10826 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RARBP10826 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RARBP10826 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RARBP10826 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RARBP10826 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RARBP10826 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RARBP10826 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RARBP10826 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RARBP10826 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RARBP10826 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RARBP10826 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RARBP10826 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RARBP10826 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RARBP10826 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RARBP10826 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RARBP10826 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RARBP10826 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RARBP10826 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RARBP10826 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RARBP10826 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RARBP10826 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
RARBP10826 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RARBP10826 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RARBP10826 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RARBP10826 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RARBP10826 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RARBP10826 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RARBP10826 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RARBP10826 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RARBP10826 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RARBP10826 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RARBP10826 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RARBP10826 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RARBP10826 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RARBP10826 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RARBP10826 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RARBP10826 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RARBP10826 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RARBP10826 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RARBP10826 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
RARBP10826 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
RARBP10826 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RARBP10826 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RARBP10826 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RARBP10826 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RARBP10826 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RARBP10826 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RARBP10826 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RARBP10826 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RARBP10826 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
RARBP10826 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RARBP10826 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RARBP10826 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RARBP10826 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RARBP10826 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RARBP10826 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RARBP10826 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RARBP10826 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RARBP10826 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RARBP10826 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RARBP10826 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RARBP10826 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RARBP10826 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RARBP10826 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RARBP10826 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RARBP10826 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RARBP10826 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RARBP10826 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RARBP10826 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RARBP10826 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RARBP10826 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RARBP10826 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RARBP10826 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RARBP10826 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RARBP10826 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RARBP10826 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RARBP10826 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
RARBP10826 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RARBP10826 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms