Protein–RNA interactions for Protein: P0CW27

CCDC166, Coiled-coil domain-containing protein 166, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC166P0CW27 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC166P0CW27 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CCDC166P0CW27 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CCDC166P0CW27 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CCDC166P0CW27 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CCDC166P0CW27 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CCDC166P0CW27 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC166P0CW27 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC166P0CW27 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC166P0CW27 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC166P0CW27 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC166P0CW27 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC166P0CW27 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC166P0CW27 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC166P0CW27 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC166P0CW27 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC166P0CW27 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC166P0CW27 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC166P0CW27 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC166P0CW27 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC166P0CW27 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC166P0CW27 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC166P0CW27 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC166P0CW27 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC166P0CW27 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC166P0CW27 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC166P0CW27 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC166P0CW27 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC166P0CW27 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC166P0CW27 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC166P0CW27 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC166P0CW27 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC166P0CW27 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC166P0CW27 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC166P0CW27 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC166P0CW27 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC166P0CW27 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC166P0CW27 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC166P0CW27 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC166P0CW27 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC166P0CW27 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC166P0CW27 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC166P0CW27 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC166P0CW27 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC166P0CW27 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC166P0CW27 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC166P0CW27 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC166P0CW27 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC166P0CW27 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC166P0CW27 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC166P0CW27 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC166P0CW27 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC166P0CW27 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC166P0CW27 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC166P0CW27 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC166P0CW27 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC166P0CW27 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC166P0CW27 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC166P0CW27 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC166P0CW27 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC166P0CW27 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC166P0CW27 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC166P0CW27 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC166P0CW27 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC166P0CW27 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC166P0CW27 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC166P0CW27 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC166P0CW27 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC166P0CW27 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC166P0CW27 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC166P0CW27 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC166P0CW27 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC166P0CW27 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC166P0CW27 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC166P0CW27 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC166P0CW27 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC166P0CW27 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC166P0CW27 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC166P0CW27 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC166P0CW27 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC166P0CW27 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC166P0CW27 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC166P0CW27 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC166P0CW27 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC166P0CW27 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC166P0CW27 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC166P0CW27 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC166P0CW27 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC166P0CW27 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC166P0CW27 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC166P0CW27 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC166P0CW27 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC166P0CW27 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC166P0CW27 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC166P0CW27 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC166P0CW27 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC166P0CW27 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC166P0CW27 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC166P0CW27 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC166P0CW27 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms