Protein–RNA interactions for Protein: P06454

PTMA, Prothymosin alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTMAP06454 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTMAP06454 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTMAP06454 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTMAP06454 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
PTMAP06454 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTMAP06454 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTMAP06454 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTMAP06454 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
PTMAP06454 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
PTMAP06454 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTMAP06454 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTMAP06454 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTMAP06454 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTMAP06454 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
PTMAP06454 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTMAP06454 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTMAP06454 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTMAP06454 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTMAP06454 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTMAP06454 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTMAP06454 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
PTMAP06454 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTMAP06454 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTMAP06454 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PTMAP06454 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PTMAP06454 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
PTMAP06454 RAPGEF1-202ENST00000372190 6045 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PTMAP06454 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PTMAP06454 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PTMAP06454 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PTMAP06454 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PTMAP06454 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PTMAP06454 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PTMAP06454 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PTMAP06454 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PTMAP06454 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PTMAP06454 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PTMAP06454 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTMAP06454 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTMAP06454 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTMAP06454 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTMAP06454 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTMAP06454 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTMAP06454 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTMAP06454 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTMAP06454 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTMAP06454 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTMAP06454 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTMAP06454 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTMAP06454 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTMAP06454 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTMAP06454 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTMAP06454 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTMAP06454 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTMAP06454 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTMAP06454 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTMAP06454 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTMAP06454 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTMAP06454 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTMAP06454 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
PTMAP06454 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTMAP06454 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTMAP06454 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTMAP06454 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTMAP06454 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTMAP06454 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTMAP06454 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTMAP06454 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTMAP06454 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTMAP06454 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTMAP06454 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTMAP06454 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTMAP06454 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTMAP06454 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTMAP06454 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTMAP06454 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTMAP06454 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTMAP06454 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTMAP06454 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTMAP06454 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTMAP06454 AC009690.1-201ENST00000379915 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTMAP06454 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTMAP06454 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTMAP06454 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTMAP06454 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTMAP06454 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTMAP06454 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTMAP06454 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PTMAP06454 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTMAP06454 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTMAP06454 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTMAP06454 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTMAP06454 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTMAP06454 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTMAP06454 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTMAP06454 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTMAP06454 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTMAP06454 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTMAP06454 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTMAP06454 SUGP2-215ENST00000601879 5546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms