Protein–RNA interactions for Protein: P05107

ITGB2, Integrin beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 769 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB2P05107 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGB2P05107 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGB2P05107 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGB2P05107 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGB2P05107 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGB2P05107 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGB2P05107 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGB2P05107 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGB2P05107 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGB2P05107 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGB2P05107 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGB2P05107 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGB2P05107 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGB2P05107 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGB2P05107 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGB2P05107 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGB2P05107 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGB2P05107 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGB2P05107 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGB2P05107 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGB2P05107 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGB2P05107 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGB2P05107 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGB2P05107 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGB2P05107 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGB2P05107 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGB2P05107 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGB2P05107 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGB2P05107 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGB2P05107 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGB2P05107 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGB2P05107 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGB2P05107 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGB2P05107 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGB2P05107 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGB2P05107 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGB2P05107 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGB2P05107 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGB2P05107 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGB2P05107 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGB2P05107 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGB2P05107 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGB2P05107 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGB2P05107 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGB2P05107 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGB2P05107 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGB2P05107 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGB2P05107 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGB2P05107 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGB2P05107 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGB2P05107 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGB2P05107 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGB2P05107 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGB2P05107 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGB2P05107 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGB2P05107 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGB2P05107 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGB2P05107 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGB2P05107 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGB2P05107 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGB2P05107 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGB2P05107 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGB2P05107 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGB2P05107 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGB2P05107 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGB2P05107 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGB2P05107 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGB2P05107 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGB2P05107 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGB2P05107 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGB2P05107 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGB2P05107 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGB2P05107 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGB2P05107 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGB2P05107 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGB2P05107 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGB2P05107 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGB2P05107 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGB2P05107 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGB2P05107 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGB2P05107 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGB2P05107 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGB2P05107 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGB2P05107 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGB2P05107 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGB2P05107 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGB2P05107 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGB2P05107 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGB2P05107 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGB2P05107 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGB2P05107 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGB2P05107 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGB2P05107 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGB2P05107 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGB2P05107 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGB2P05107 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGB2P05107 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGB2P05107 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGB2P05107 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGB2P05107 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms