Protein–RNA interactions for Protein: P04279

SEMG1, Semenogelin-1, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMG1P04279 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
SEMG1P04279 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SEMG1P04279 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SEMG1P04279 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SEMG1P04279 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SEMG1P04279 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SEMG1P04279 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SEMG1P04279 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SEMG1P04279 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SEMG1P04279 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SEMG1P04279 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SEMG1P04279 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SEMG1P04279 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SEMG1P04279 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SEMG1P04279 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SEMG1P04279 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SEMG1P04279 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
SEMG1P04279 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SEMG1P04279 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SEMG1P04279 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SEMG1P04279 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SEMG1P04279 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SEMG1P04279 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SEMG1P04279 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SEMG1P04279 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SEMG1P04279 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SEMG1P04279 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SEMG1P04279 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SEMG1P04279 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SEMG1P04279 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
SEMG1P04279 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SEMG1P04279 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SEMG1P04279 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SEMG1P04279 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SEMG1P04279 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SEMG1P04279 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SEMG1P04279 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SEMG1P04279 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SEMG1P04279 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SEMG1P04279 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SEMG1P04279 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SEMG1P04279 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SEMG1P04279 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SEMG1P04279 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SEMG1P04279 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SEMG1P04279 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SEMG1P04279 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SEMG1P04279 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SEMG1P04279 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SEMG1P04279 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SEMG1P04279 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SEMG1P04279 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SEMG1P04279 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SEMG1P04279 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SEMG1P04279 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SEMG1P04279 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SEMG1P04279 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SEMG1P04279 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SEMG1P04279 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SEMG1P04279 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SEMG1P04279 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SEMG1P04279 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SEMG1P04279 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SEMG1P04279 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SEMG1P04279 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SEMG1P04279 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SEMG1P04279 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SEMG1P04279 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SEMG1P04279 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SEMG1P04279 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SEMG1P04279 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SEMG1P04279 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SEMG1P04279 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SEMG1P04279 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SEMG1P04279 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SEMG1P04279 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SEMG1P04279 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SEMG1P04279 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SEMG1P04279 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SEMG1P04279 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SEMG1P04279 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SEMG1P04279 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SEMG1P04279 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SEMG1P04279 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SEMG1P04279 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SEMG1P04279 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.06■□□□□ 0
SEMG1P04279 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SEMG1P04279 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SEMG1P04279 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SEMG1P04279 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SEMG1P04279 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SEMG1P04279 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SEMG1P04279 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SEMG1P04279 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SEMG1P04279 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SEMG1P04279 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SEMG1P04279 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SEMG1P04279 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SEMG1P04279 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SEMG1P04279 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms