Protein–RNA interactions for Protein: P02748

C9, Complement component C9, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9P02748 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9P02748 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9P02748 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9P02748 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9P02748 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
C9P02748 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9P02748 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
C9P02748 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9P02748 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
C9P02748 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9P02748 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9P02748 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9P02748 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9P02748 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9P02748 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9P02748 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9P02748 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9P02748 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9P02748 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9P02748 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
C9P02748 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9P02748 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9P02748 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9P02748 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9P02748 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9P02748 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9P02748 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9P02748 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9P02748 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9P02748 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9P02748 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
C9P02748 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9P02748 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
C9P02748 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9P02748 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9P02748 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9P02748 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9P02748 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9P02748 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C9P02748 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C9P02748 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C9P02748 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C9P02748 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C9P02748 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C9P02748 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C9P02748 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C9P02748 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C9P02748 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C9P02748 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C9P02748 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C9P02748 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C9P02748 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C9P02748 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C9P02748 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C9P02748 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C9P02748 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C9P02748 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C9P02748 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C9P02748 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C9P02748 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C9P02748 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C9P02748 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C9P02748 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
C9P02748 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C9P02748 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C9P02748 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C9P02748 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C9P02748 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C9P02748 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C9P02748 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
C9P02748 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
C9P02748 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C9P02748 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
C9P02748 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C9P02748 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
C9P02748 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
C9P02748 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C9P02748 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C9P02748 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
C9P02748 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C9P02748 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C9P02748 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C9P02748 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C9P02748 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
C9P02748 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
C9P02748 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
C9P02748 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
C9P02748 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
C9P02748 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
C9P02748 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
C9P02748 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C9P02748 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C9P02748 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C9P02748 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C9P02748 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C9P02748 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C9P02748 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
C9P02748 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C9P02748 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C9P02748 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms