Protein–RNA interactions for Protein: O95149

SNUPN, Snurportin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNUPNO95149 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNUPNO95149 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNUPNO95149 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNUPNO95149 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNUPNO95149 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNUPNO95149 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNUPNO95149 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNUPNO95149 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SNUPNO95149 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNUPNO95149 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNUPNO95149 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNUPNO95149 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SNUPNO95149 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNUPNO95149 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNUPNO95149 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNUPNO95149 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SNUPNO95149 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNUPNO95149 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNUPNO95149 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNUPNO95149 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNUPNO95149 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNUPNO95149 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SNUPNO95149 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNUPNO95149 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNUPNO95149 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SNUPNO95149 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNUPNO95149 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SNUPNO95149 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNUPNO95149 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNUPNO95149 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNUPNO95149 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNUPNO95149 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNUPNO95149 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SNUPNO95149 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNUPNO95149 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNUPNO95149 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNUPNO95149 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNUPNO95149 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNUPNO95149 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNUPNO95149 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNUPNO95149 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNUPNO95149 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNUPNO95149 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNUPNO95149 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNUPNO95149 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNUPNO95149 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNUPNO95149 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNUPNO95149 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNUPNO95149 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNUPNO95149 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNUPNO95149 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNUPNO95149 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNUPNO95149 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNUPNO95149 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNUPNO95149 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNUPNO95149 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNUPNO95149 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNUPNO95149 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNUPNO95149 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNUPNO95149 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SNUPNO95149 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNUPNO95149 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNUPNO95149 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNUPNO95149 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNUPNO95149 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNUPNO95149 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNUPNO95149 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNUPNO95149 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNUPNO95149 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNUPNO95149 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNUPNO95149 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNUPNO95149 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNUPNO95149 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNUPNO95149 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNUPNO95149 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNUPNO95149 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNUPNO95149 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNUPNO95149 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNUPNO95149 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNUPNO95149 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNUPNO95149 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNUPNO95149 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNUPNO95149 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNUPNO95149 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNUPNO95149 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNUPNO95149 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNUPNO95149 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNUPNO95149 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNUPNO95149 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNUPNO95149 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNUPNO95149 CABP4-201ENST00000325656 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNUPNO95149 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNUPNO95149 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNUPNO95149 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNUPNO95149 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNUPNO95149 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNUPNO95149 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNUPNO95149 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNUPNO95149 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNUPNO95149 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms