Protein–RNA interactions for Protein: O60931

CTNS, Cystinosin, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNSO60931 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CTNSO60931 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CTNSO60931 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
CTNSO60931 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTNSO60931 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTNSO60931 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTNSO60931 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTNSO60931 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTNSO60931 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTNSO60931 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTNSO60931 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTNSO60931 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTNSO60931 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CTNSO60931 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTNSO60931 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTNSO60931 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTNSO60931 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTNSO60931 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CTNSO60931 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CTNSO60931 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CTNSO60931 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTNSO60931 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTNSO60931 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTNSO60931 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CTNSO60931 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTNSO60931 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTNSO60931 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTNSO60931 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTNSO60931 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTNSO60931 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTNSO60931 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTNSO60931 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTNSO60931 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTNSO60931 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTNSO60931 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTNSO60931 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTNSO60931 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTNSO60931 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTNSO60931 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTNSO60931 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTNSO60931 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTNSO60931 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTNSO60931 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTNSO60931 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTNSO60931 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTNSO60931 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTNSO60931 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTNSO60931 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTNSO60931 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTNSO60931 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTNSO60931 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTNSO60931 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTNSO60931 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTNSO60931 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTNSO60931 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTNSO60931 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTNSO60931 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTNSO60931 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTNSO60931 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTNSO60931 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTNSO60931 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTNSO60931 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTNSO60931 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTNSO60931 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTNSO60931 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTNSO60931 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTNSO60931 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTNSO60931 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTNSO60931 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTNSO60931 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTNSO60931 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTNSO60931 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTNSO60931 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTNSO60931 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTNSO60931 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTNSO60931 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTNSO60931 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTNSO60931 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTNSO60931 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTNSO60931 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTNSO60931 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTNSO60931 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTNSO60931 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTNSO60931 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTNSO60931 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTNSO60931 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTNSO60931 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTNSO60931 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTNSO60931 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTNSO60931 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTNSO60931 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTNSO60931 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTNSO60931 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTNSO60931 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTNSO60931 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTNSO60931 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTNSO60931 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTNSO60931 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTNSO60931 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTNSO60931 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.5 ms