Protein–RNA interactions for Protein: O00716

E2F3, Transcription factor E2F3, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F3O00716 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
E2F3O00716 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
E2F3O00716 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
E2F3O00716 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
E2F3O00716 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
E2F3O00716 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
E2F3O00716 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
E2F3O00716 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
E2F3O00716 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
E2F3O00716 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
E2F3O00716 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
E2F3O00716 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
E2F3O00716 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
E2F3O00716 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
E2F3O00716 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
E2F3O00716 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
E2F3O00716 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
E2F3O00716 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
E2F3O00716 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
E2F3O00716 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
E2F3O00716 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
E2F3O00716 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
E2F3O00716 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
E2F3O00716 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
E2F3O00716 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
E2F3O00716 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
E2F3O00716 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
E2F3O00716 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
E2F3O00716 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
E2F3O00716 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
E2F3O00716 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
E2F3O00716 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
E2F3O00716 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
E2F3O00716 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
E2F3O00716 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
E2F3O00716 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
E2F3O00716 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
E2F3O00716 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
E2F3O00716 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
E2F3O00716 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
E2F3O00716 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
E2F3O00716 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
E2F3O00716 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
E2F3O00716 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
E2F3O00716 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
E2F3O00716 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
E2F3O00716 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
E2F3O00716 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
E2F3O00716 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
E2F3O00716 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
E2F3O00716 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
E2F3O00716 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
E2F3O00716 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
E2F3O00716 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
E2F3O00716 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
E2F3O00716 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
E2F3O00716 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
E2F3O00716 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
E2F3O00716 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
E2F3O00716 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
E2F3O00716 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
E2F3O00716 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
E2F3O00716 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
E2F3O00716 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
E2F3O00716 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
E2F3O00716 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
E2F3O00716 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
E2F3O00716 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
E2F3O00716 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
E2F3O00716 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
E2F3O00716 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
E2F3O00716 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
E2F3O00716 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
E2F3O00716 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
E2F3O00716 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
E2F3O00716 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
E2F3O00716 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
E2F3O00716 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
E2F3O00716 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
E2F3O00716 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
E2F3O00716 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
E2F3O00716 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
E2F3O00716 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
E2F3O00716 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
E2F3O00716 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
E2F3O00716 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
E2F3O00716 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
E2F3O00716 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
E2F3O00716 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
E2F3O00716 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
E2F3O00716 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
E2F3O00716 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
E2F3O00716 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
E2F3O00716 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
E2F3O00716 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
E2F3O00716 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
E2F3O00716 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
E2F3O00716 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
E2F3O00716 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
E2F3O00716 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.5 ms